More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2339 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 868 aa  1770    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  49.36 
 
 		 875 aa  820    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  47.87 
 
 		 853 aa  778    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  60.77 
 
 		 853 aa  1033    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  38.8 
 
 		 868 aa  597  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  39.46 
 
 		 898 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  37.05 
 
 		 893 aa  533  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  34.72 
 
 		 870 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  38 
 
 		 877 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  37.86 
 
 		 918 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  36.08 
 
 		 830 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  37.31 
 
 		 884 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  34.5 
 
 		 871 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  34.12 
 
 		 887 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  35.2 
 
 		 1037 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  33.33 
 
 		 817 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  33.49 
 
 		 1062 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  31.81 
 
 		 828 aa  355  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  29.86 
 
 		 887 aa  336  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.73 
 
 		 861 aa  331  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  30.21 
 
 		 819 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  29.04 
 
 		 859 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  30.06 
 
 		 931 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.09 
 
 		 811 aa  281  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  31.69 
 
 		 923 aa  280  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  36.93 
 
 		 824 aa  263  1e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  34.87 
 
 		 779 aa  260  7e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.08 
 
 		 869 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  34.51 
 
 		 754 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 		 781 aa  240  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  34.45 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  36.27 
 
 		 794 aa  239  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  33.64 
 
 		 757 aa  238  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  34.09 
 
 		 758 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  36.06 
 
 		 794 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  35.36 
 
 		 769 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  34.29 
 
 		 758 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  33.84 
 
 		 758 aa  234  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  34.29 
 
 		 758 aa  233  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  36.25 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  36.25 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  35.83 
 
 		 800 aa  230  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  35.08 
 
 		 800 aa  230  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  35.83 
 
 		 800 aa  230  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  35.83 
 
 		 800 aa  230  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  35.83 
 
 		 799 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  35.83 
 
 		 799 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  33.69 
 
 		 794 aa  228  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  35.17 
 
 		 796 aa  228  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  35.08 
 
 		 801 aa  228  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  35.59 
 
 		 795 aa  228  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  34.29 
 
 		 758 aa  227  6e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  34.49 
 
 		 790 aa  228  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  34.66 
 
 		 812 aa  227  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  34.66 
 
 		 799 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  34.66 
 
 		 799 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  34.66 
 
 		 799 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  34.66 
 
 		 799 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  34.66 
 
 		 799 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  34.66 
 
 		 799 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  35.42 
 
 		 800 aa  226  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  35.01 
 
 		 761 aa  225  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  34.34 
 
 		 799 aa  225  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  36.66 
 
 		 797 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  35.17 
 
 		 795 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 803 aa  224  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  34.45 
 
 		 801 aa  223  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  35.38 
 
 		 795 aa  223  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  34.28 
 
 		 789 aa  223  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.67 
 
 		 810 aa  223  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  35.16 
 
 		 762 aa  221  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  35.09 
 
 		 782 aa  219  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  36.02 
 
 		 791 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  35.91 
 
 		 786 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  34.09 
 
 		 798 aa  218  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  35.79 
 
 		 791 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  32.73 
 
 		 791 aa  217  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  35.37 
 
 		 791 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 790 aa  217  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  36.1 
 
 		 790 aa  217  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  34.4 
 
 		 761 aa  216  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  36.1 
 
 		 792 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  35.33 
 
 		 801 aa  216  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  36.59 
 
 		 760 aa  215  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  32.75 
 
 		 794 aa  215  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 764 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  32.85 
 
 		 795 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  34.68 
 
 		 792 aa  214  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  35.43 
 
 		 790 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 791 aa  214  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  34.06 
 
 		 795 aa  214  7e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  32.75 
 
 		 794 aa  214  7.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 791 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  35.87 
 
 		 791 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  36.1 
 
 		 791 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  34.01 
 
 		 792 aa  213  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  36.1 
 
 		 791 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  33.56 
 
 		 792 aa  212  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  33.56 
 
 		 792 aa  212  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  33.56 
 
 		 792 aa  212  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>