More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1988 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 817 aa  1662    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  43.88 
 
 		 828 aa  612  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  39.56 
 
 		 859 aa  552  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.93 
 
 		 861 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.65 
 
 		 811 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  33.33 
 
 		 868 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  32.6 
 
 		 1062 aa  392  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  32.02 
 
 		 871 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.93 
 
 		 1037 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  31.85 
 
 		 893 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  30.7 
 
 		 875 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  31.03 
 
 		 868 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.23 
 
 		 853 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  33.05 
 
 		 884 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  31.52 
 
 		 887 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  31.45 
 
 		 853 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  32.08 
 
 		 819 aa  352  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  31.12 
 
 		 870 aa  347  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  32.23 
 
 		 918 aa  343  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  31.55 
 
 		 898 aa  340  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.92 
 
 		 830 aa  340  8e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  30.23 
 
 		 877 aa  308  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  28.05 
 
 		 887 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  31.07 
 
 		 923 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  27.53 
 
 		 931 aa  259  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.77 
 
 		 869 aa  210  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  31.07 
 
 		 762 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  31.21 
 
 		 758 aa  183  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  32.71 
 
 		 754 aa  182  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  29.58 
 
 		 762 aa  181  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  31.03 
 
 		 758 aa  180  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  30.91 
 
 		 761 aa  180  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  30.72 
 
 		 758 aa  178  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  28.87 
 
 		 769 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  30.68 
 
 		 866 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  28.77 
 
 		 782 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  30.17 
 
 		 781 aa  172  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  30.68 
 
 		 761 aa  171  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  29.48 
 
 		 758 aa  170  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  30.5 
 
 		 779 aa  167  6.9999999999999995e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  31.81 
 
 		 809 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  31.24 
 
 		 800 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  31.24 
 
 		 800 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  30.85 
 
 		 795 aa  163  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  31.24 
 
 		 800 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  31.26 
 
 		 760 aa  163  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  31.6 
 
 		 799 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  31.67 
 
 		 800 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  31.6 
 
 		 799 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  31.17 
 
 		 790 aa  162  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  28.07 
 
 		 764 aa  162  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  31.61 
 
 		 791 aa  161  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  31.61 
 
 		 800 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  30.8 
 
 		 801 aa  160  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  31.4 
 
 		 792 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  30.79 
 
 		 815 aa  160  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  31.8 
 
 		 812 aa  159  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  30.52 
 
 		 790 aa  158  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  30.71 
 
 		 796 aa  159  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  29.75 
 
 		 790 aa  158  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  27.38 
 
 		 758 aa  158  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  30.59 
 
 		 799 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  31.4 
 
 		 801 aa  157  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  31.22 
 
 		 801 aa  157  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  31 
 
 		 791 aa  156  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  28.07 
 
 		 758 aa  156  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  29.37 
 
 		 795 aa  156  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  32.11 
 
 		 790 aa  157  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  33.03 
 
 		 787 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  29.91 
 
 		 789 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  30.54 
 
 		 812 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  30.54 
 
 		 799 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  30.54 
 
 		 799 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  30.54 
 
 		 799 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  30.54 
 
 		 799 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  29.3 
 
 		 805 aa  155  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  30.54 
 
 		 799 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  30.54 
 
 		 799 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  30.94 
 
 		 800 aa  155  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  29.76 
 
 		 794 aa  155  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  29.3 
 
 		 784 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  26.18 
 
 		 757 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  30.32 
 
 		 799 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  30.33 
 
 		 797 aa  154  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  27.94 
 
 		 758 aa  154  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  31.34 
 
 		 794 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  31.37 
 
 		 795 aa  153  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  30.09 
 
 		 791 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  31.14 
 
 		 789 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  29.76 
 
 		 794 aa  152  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  30.91 
 
 		 789 aa  152  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  31.48 
 
 		 810 aa  152  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  31 
 
 		 803 aa  152  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  27.84 
 
 		 824 aa  152  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  30.84 
 
 		 795 aa  151  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  30.57 
 
 		 791 aa  151  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  29.48 
 
 		 796 aa  151  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  30.09 
 
 		 791 aa  151  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  30.68 
 
 		 789 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  30.68 
 
 		 789 aa  150  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>