More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2731 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  48.73 
 
 
828 aa  775    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  55.59 
 
 
861 aa  939    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  100 
 
 
859 aa  1722    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  39.33 
 
 
817 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  36.36 
 
 
811 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  33.37 
 
 
1037 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  29.63 
 
 
868 aa  355  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  28.32 
 
 
887 aa  354  5e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.52 
 
 
853 aa  344  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.34 
 
 
830 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  30.31 
 
 
868 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  31.16 
 
 
871 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  28.47 
 
 
870 aa  327  7e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  29.38 
 
 
853 aa  327  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  28.19 
 
 
893 aa  326  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  30.41 
 
 
898 aa  320  7e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  30.39 
 
 
819 aa  318  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  28.75 
 
 
875 aa  312  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  32.08 
 
 
884 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  30.06 
 
 
877 aa  295  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  29.28 
 
 
918 aa  281  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  26.56 
 
 
887 aa  239  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  31.64 
 
 
923 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  34.45 
 
 
1062 aa  218  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  25.88 
 
 
931 aa  198  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.94 
 
 
869 aa  187  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  29.14 
 
 
779 aa  175  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  31.2 
 
 
781 aa  170  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  28.45 
 
 
758 aa  168  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  30.5 
 
 
761 aa  163  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  28.85 
 
 
764 aa  161  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  30.28 
 
 
866 aa  160  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  30.15 
 
 
762 aa  159  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  28.4 
 
 
769 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  30.04 
 
 
762 aa  157  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  29.01 
 
 
758 aa  156  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  30.27 
 
 
754 aa  156  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  28.13 
 
 
758 aa  155  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  30.83 
 
 
780 aa  153  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  26.34 
 
 
758 aa  152  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  30.07 
 
 
824 aa  150  8e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  27.78 
 
 
758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  28.23 
 
 
761 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  25.83 
 
 
758 aa  145  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  32.77 
 
 
779 aa  145  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  27.75 
 
 
782 aa  145  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  28.39 
 
 
800 aa  145  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  25.61 
 
 
757 aa  144  8e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  28.99 
 
 
799 aa  143  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
801 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  26.03 
 
 
758 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  29.14 
 
 
793 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  29.39 
 
 
794 aa  142  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  31.92 
 
 
760 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  28.22 
 
 
815 aa  140  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  27.44 
 
 
794 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  29.35 
 
 
809 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  27.97 
 
 
801 aa  138  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  27.72 
 
 
789 aa  138  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  27.72 
 
 
789 aa  138  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  30.5 
 
 
785 aa  138  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  27.97 
 
 
794 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 
787 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  28.05 
 
 
795 aa  137  7.000000000000001e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  29.47 
 
 
789 aa  137  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  28.19 
 
 
794 aa  137  8e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  30.17 
 
 
810 aa  137  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  27.93 
 
 
789 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  27.06 
 
 
801 aa  136  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
799 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  27.71 
 
 
791 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
800 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
800 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  28.85 
 
 
805 aa  136  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
800 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
812 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  27.51 
 
 
789 aa  135  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  28.57 
 
 
785 aa  135  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
799 aa  135  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0685  hypothetical protein  32.27 
 
 
565 aa  135  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  27.73 
 
 
789 aa  135  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
799 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
799 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
799 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
799 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
799 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
799 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  28.21 
 
 
790 aa  134  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  27.18 
 
 
791 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  29.07 
 
 
809 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  26.77 
 
 
790 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  28.66 
 
 
792 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.38 
 
 
810 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  29.74 
 
 
796 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  29.74 
 
 
796 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  25.7 
 
 
794 aa  132  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  28.18 
 
 
800 aa  132  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  27.35 
 
 
808 aa  132  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  27.75 
 
 
799 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  27.75 
 
 
799 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>