More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2815 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  51.23 
 
 		 853 aa  826    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  47.84 
 
 		 875 aa  788    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  60.77 
 
 		 868 aa  1033    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 853 aa  1741    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  38.45 
 
 		 868 aa  576  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  35.95 
 
 		 893 aa  548  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  40.64 
 
 		 898 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  36.27 
 
 		 870 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  37.51 
 
 		 884 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  36.12 
 
 		 830 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  34.87 
 
 		 887 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  37.09 
 
 		 877 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  35.87 
 
 		 918 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  33.64 
 
 		 871 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  35.17 
 
 		 1037 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  35.11 
 
 		 1062 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  31.45 
 
 		 817 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  30.95 
 
 		 819 aa  350  6e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  29.66 
 
 		 887 aa  345  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  31.25 
 
 		 828 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  29.38 
 
 		 859 aa  320  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.17 
 
 		 861 aa  318  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  30.16 
 
 		 931 aa  300  6e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  32.96 
 
 		 923 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  35.33 
 
 		 824 aa  273  1e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.26 
 
 		 811 aa  265  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  36.87 
 
 		 781 aa  260  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  34.93 
 
 		 779 aa  259  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  35.54 
 
 		 754 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 798 aa  253  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 794 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.67 
 
 		 869 aa  245  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  34.68 
 
 		 769 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  33.06 
 
 		 758 aa  239  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  34.95 
 
 		 782 aa  237  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  32.52 
 
 		 757 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  34.89 
 
 		 800 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  32.85 
 
 		 758 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  34.43 
 
 		 799 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  36.32 
 
 		 762 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  34.43 
 
 		 799 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  34.43 
 
 		 799 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 801 aa  234  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  34.43 
 
 		 800 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  34.43 
 
 		 800 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  34.43 
 
 		 800 aa  234  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  33.98 
 
 		 799 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  33.92 
 
 		 758 aa  233  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 812 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  34.23 
 
 		 801 aa  233  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  34.85 
 
 		 801 aa  233  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  33.7 
 
 		 758 aa  231  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  33.81 
 
 		 800 aa  232  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  34.24 
 
 		 778 aa  230  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  33.85 
 
 		 758 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  33.03 
 
 		 758 aa  229  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  35.22 
 
 		 793 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  36.29 
 
 		 810 aa  228  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  34.82 
 
 		 785 aa  227  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  34.54 
 
 		 761 aa  227  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 789 aa  226  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  32.54 
 
 		 762 aa  226  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  35.05 
 
 		 800 aa  226  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  34.57 
 
 		 809 aa  226  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  34.05 
 
 		 796 aa  225  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  33.85 
 
 		 795 aa  225  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  34.41 
 
 		 795 aa  224  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  34.71 
 
 		 791 aa  224  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 		 790 aa  224  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  36.12 
 
 		 790 aa  223  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  34.27 
 
 		 791 aa  223  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  32.13 
 
 		 800 aa  223  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  31.93 
 
 		 805 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  32.71 
 
 		 799 aa  223  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  34.66 
 
 		 784 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 		 795 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  34.06 
 
 		 791 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 758 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  35.94 
 
 		 806 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  34.65 
 
 		 812 aa  222  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  32.3 
 
 		 791 aa  222  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  34.19 
 
 		 798 aa  222  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 815 aa  222  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  35.24 
 
 		 809 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 		 785 aa  221  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  33.84 
 
 		 791 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  35.06 
 
 		 801 aa  221  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  33.84 
 
 		 791 aa  221  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  31.86 
 
 		 803 aa  220  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  34.32 
 
 		 799 aa  220  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  35.19 
 
 		 799 aa  221  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  34.22 
 
 		 792 aa  219  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  34.22 
 
 		 792 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  33.84 
 
 		 791 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>