More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1644 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 853 aa  1748    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  43.57 
 
 		 875 aa  700    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  47.87 
 
 		 868 aa  778    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  51.23 
 
 		 853 aa  826    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  35.57 
 
 		 868 aa  525  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  38.44 
 
 		 898 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  34.71 
 
 		 893 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  35.11 
 
 		 830 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  33.52 
 
 		 887 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  33.1 
 
 		 870 aa  445  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  33.87 
 
 		 884 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  34.04 
 
 		 1062 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.85 
 
 		 1037 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  32.92 
 
 		 918 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  31.75 
 
 		 871 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  33.05 
 
 		 877 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  32.23 
 
 		 817 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  30.74 
 
 		 819 aa  352  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  31.4 
 
 		 828 aa  340  8e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  30.21 
 
 		 859 aa  337  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.39 
 
 		 861 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  31.51 
 
 		 923 aa  296  8e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.66 
 
 		 811 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  27.45 
 
 		 887 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  27.78 
 
 		 931 aa  263  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  35.16 
 
 		 769 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  34.09 
 
 		 824 aa  244  5e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  33.63 
 
 		 758 aa  242  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  34.69 
 
 		 781 aa  240  9e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  34.72 
 
 		 754 aa  239  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 779 aa  233  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  32.81 
 
 		 758 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 762 aa  226  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  34.31 
 
 		 758 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 761 aa  226  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  31.61 
 
 		 758 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  31.88 
 
 		 794 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 762 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  31.98 
 
 		 757 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  34.09 
 
 		 758 aa  219  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  32.29 
 
 		 758 aa  219  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 758 aa  217  7e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  32.44 
 
 		 761 aa  215  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  33.63 
 
 		 798 aa  214  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  32.41 
 
 		 764 aa  210  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  34.47 
 
 		 792 aa  209  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  33.19 
 
 		 760 aa  209  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.41 
 
 		 869 aa  208  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  32.42 
 
 		 788 aa  207  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  32.26 
 
 		 805 aa  206  1e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 809 aa  206  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  31.71 
 
 		 782 aa  205  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 796 aa  205  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 		 792 aa  204  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 760 aa  204  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 		 792 aa  205  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  32.46 
 
 		 809 aa  204  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 791 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  32.37 
 
 		 795 aa  204  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 		 792 aa  204  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 		 792 aa  204  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  32.64 
 
 		 794 aa  204  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  32.64 
 
 		 794 aa  204  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  31.95 
 
 		 792 aa  204  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 		 792 aa  204  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 		 792 aa  204  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 		 792 aa  204  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 		 792 aa  204  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  32.64 
 
 		 794 aa  204  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 		 792 aa  204  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  31.97 
 
 		 796 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  33.62 
 
 		 812 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  31.71 
 
 		 790 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  31.76 
 
 		 796 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  31.76 
 
 		 796 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  31.99 
 
 		 791 aa  201  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  31.97 
 
 		 796 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  31.99 
 
 		 791 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  32.59 
 
 		 791 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  32.18 
 
 		 792 aa  200  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  32.59 
 
 		 791 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  32.8 
 
 		 792 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  33.56 
 
 		 810 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  32.59 
 
 		 791 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  32.21 
 
 		 792 aa  198  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  31.48 
 
 		 801 aa  198  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  32.44 
 
 		 791 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  31.28 
 
 		 780 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 		 792 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  31.46 
 
 		 797 aa  198  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  32.1 
 
 		 800 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  31.77 
 
 		 791 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  30.3 
 
 		 799 aa  197  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  29.71 
 
 		 785 aa  197  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 		 792 aa  197  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  30.19 
 
 		 803 aa  197  9e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  30.63 
 
 		 785 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  32.46 
 
 		 810 aa  197  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  31.97 
 
 		 795 aa  196  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  31.77 
 
 		 790 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>