More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2393 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 819 aa  1663    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  31.58 
 
 		 893 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  30.09 
 
 		 868 aa  358  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.32 
 
 		 1037 aa  352  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  32.08 
 
 		 817 aa  352  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.74 
 
 		 853 aa  352  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  30.95 
 
 		 853 aa  350  6e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  29.26 
 
 		 887 aa  346  8e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  29.69 
 
 		 898 aa  341  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.06 
 
 		 830 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  31.05 
 
 		 828 aa  330  9e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  31.44 
 
 		 1062 aa  330  9e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  30.21 
 
 		 868 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  27.63 
 
 		 875 aa  328  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  29.37 
 
 		 918 aa  327  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  28.18 
 
 		 870 aa  325  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  30.22 
 
 		 871 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  30.25 
 
 		 884 aa  316  9e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  30.58 
 
 		 859 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.32 
 
 		 861 aa  293  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.59 
 
 		 811 aa  281  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  28.69 
 
 		 877 aa  278  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  26.39 
 
 		 887 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  30.95 
 
 		 923 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  26.05 
 
 		 931 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.85 
 
 		 869 aa  187  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  28.02 
 
 		 758 aa  169  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  26.77 
 
 		 769 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  28.54 
 
 		 781 aa  160  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  27.79 
 
 		 795 aa  160  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  28.25 
 
 		 782 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  27.79 
 
 		 790 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  25.76 
 
 		 758 aa  156  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  26.96 
 
 		 779 aa  154  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  28.91 
 
 		 800 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  27.7 
 
 		 801 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  25.76 
 
 		 758 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  27.77 
 
 		 795 aa  154  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  28.57 
 
 		 798 aa  154  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  29.69 
 
 		 760 aa  154  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  28.22 
 
 		 798 aa  154  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3417  phosphoenolpyruvate synthase  28.22 
 
 		 798 aa  154  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0963728  normal  0.277431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  28.22 
 
 		 798 aa  154  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  28.94 
 
 		 810 aa  153  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  28.69 
 
 		 801 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  29.56 
 
 		 866 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  29.03 
 
 		 800 aa  152  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  26.25 
 
 		 789 aa  151  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  29.75 
 
 		 809 aa  151  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  26.3 
 
 		 789 aa  151  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  28.25 
 
 		 809 aa  151  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  28.73 
 
 		 798 aa  151  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  26.67 
 
 		 808 aa  150  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  27.79 
 
 		 799 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  26.9 
 
 		 790 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  27.79 
 
 		 800 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  27.79 
 
 		 800 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  27.05 
 
 		 789 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  27.79 
 
 		 799 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  27.99 
 
 		 799 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  27.79 
 
 		 800 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  27.45 
 
 		 799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  26.3 
 
 		 789 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  27.45 
 
 		 799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  27.45 
 
 		 799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  27.45 
 
 		 812 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  27.25 
 
 		 789 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  27.45 
 
 		 799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  27.45 
 
 		 799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  27.45 
 
 		 799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  27.45 
 
 		 799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  28.76 
 
 		 790 aa  148  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  26.22 
 
 		 757 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  27.33 
 
 		 795 aa  148  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  27.59 
 
 		 800 aa  148  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  29.14 
 
 		 794 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  27.71 
 
 		 794 aa  146  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  25.98 
 
 		 805 aa  146  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  26.73 
 
 		 791 aa  146  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  27.71 
 
 		 794 aa  146  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  26.64 
 
 		 764 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  29.61 
 
 		 792 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  27.71 
 
 		 794 aa  146  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  27.12 
 
 		 795 aa  146  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  29.77 
 
 		 786 aa  145  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  26.19 
 
 		 789 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  28.63 
 
 		 790 aa  145  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  26.97 
 
 		 789 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  26.97 
 
 		 789 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  26.97 
 
 		 789 aa  145  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  26.8 
 
 		 798 aa  144  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  24.68 
 
 		 758 aa  144  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  27.19 
 
 		 789 aa  144  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  29.17 
 
 		 791 aa  144  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  26.39 
 
 		 789 aa  144  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  27.05 
 
 		 794 aa  144  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  28.28 
 
 		 792 aa  144  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  28.88 
 
 		 815 aa  143  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  26.97 
 
 		 799 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  26.56 
 
 		 754 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>