More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1987 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  51.61 
 
 		 871 aa  847    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  43.24 
 
 		 870 aa  709    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  40.64 
 
 		 887 aa  652    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 918 aa  1843    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  46.4 
 
 		 893 aa  813    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  66.45 
 
 		 884 aa  1137    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  38.88 
 
 		 887 aa  557  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  39.89 
 
 		 931 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  35.28 
 
 		 875 aa  526  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  37.97 
 
 		 868 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  35.87 
 
 		 853 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  34.02 
 
 		 868 aa  472  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.81 
 
 		 869 aa  445  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  34.49 
 
 		 877 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  35.3 
 
 		 898 aa  426  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.14 
 
 		 853 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  35.41 
 
 		 1062 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.44 
 
 		 830 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.33 
 
 		 1037 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  32.34 
 
 		 817 aa  357  6.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  29.83 
 
 		 819 aa  340  7e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  32.05 
 
 		 828 aa  331  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.73 
 
 		 861 aa  306  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.77 
 
 		 811 aa  281  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  29.18 
 
 		 859 aa  279  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  31.23 
 
 		 923 aa  271  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  32.18 
 
 		 779 aa  223  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 754 aa  219  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  32.51 
 
 		 824 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  33.93 
 
 		 799 aa  215  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  32.85 
 
 		 762 aa  207  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  33.6 
 
 		 785 aa  205  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  30.82 
 
 		 769 aa  204  7e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  30.64 
 
 		 782 aa  204  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  29 
 
 		 794 aa  201  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  31.69 
 
 		 791 aa  201  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  28.91 
 
 		 758 aa  198  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  33.03 
 
 		 866 aa  197  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  27.84 
 
 		 758 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  31.15 
 
 		 798 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  32.8 
 
 		 780 aa  196  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  32.2 
 
 		 812 aa  195  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  27.91 
 
 		 758 aa  195  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  31.59 
 
 		 781 aa  194  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  31.73 
 
 		 801 aa  194  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  33.13 
 
 		 810 aa  193  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  29.5 
 
 		 758 aa  192  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  31.18 
 
 		 795 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  32.51 
 
 		 809 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  31.07 
 
 		 801 aa  191  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  33.73 
 
 		 788 aa  191  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  30.69 
 
 		 791 aa  191  5e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  30.68 
 
 		 800 aa  191  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  32.06 
 
 		 790 aa  190  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  30.58 
 
 		 792 aa  190  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  30.58 
 
 		 792 aa  190  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  31.36 
 
 		 784 aa  190  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  32.92 
 
 		 800 aa  190  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  31.37 
 
 		 796 aa  190  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  31.85 
 
 		 812 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  31.35 
 
 		 799 aa  189  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  30.27 
 
 		 789 aa  189  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  30.58 
 
 		 792 aa  189  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  30.58 
 
 		 792 aa  189  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  31.54 
 
 		 799 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  31.54 
 
 		 799 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  30.97 
 
 		 789 aa  189  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  30.58 
 
 		 792 aa  189  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  28.1 
 
 		 758 aa  189  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  31.54 
 
 		 799 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  30.58 
 
 		 792 aa  189  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  31.54 
 
 		 799 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  31.54 
 
 		 799 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  30.58 
 
 		 792 aa  188  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  30.58 
 
 		 792 aa  189  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  31.54 
 
 		 799 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  31.15 
 
 		 795 aa  188  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  31.15 
 
 		 799 aa  188  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  31.15 
 
 		 799 aa  188  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  30.58 
 
 		 792 aa  188  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  30.77 
 
 		 789 aa  188  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  30.1 
 
 		 789 aa  188  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.17 
 
 		 810 aa  187  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  30.57 
 
 		 789 aa  187  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  30.57 
 
 		 789 aa  187  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  30.67 
 
 		 789 aa  187  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  30.56 
 
 		 795 aa  187  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  31.09 
 
 		 800 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  31.09 
 
 		 800 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  31.09 
 
 		 800 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  30.87 
 
 		 799 aa  187  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  31.12 
 
 		 785 aa  187  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  29.12 
 
 		 758 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  30.57 
 
 		 789 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  31.15 
 
 		 800 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  30.57 
 
 		 789 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  30.82 
 
 		 793 aa  186  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  30.57 
 
 		 789 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  30.57 
 
 		 789 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  28.15 
 
 		 757 aa  186  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>