More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0634 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 898 aa  1831    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  39.46 
 
 		 868 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  39.13 
 
 		 875 aa  575  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  40.64 
 
 		 853 aa  566  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.54 
 
 		 853 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  36.17 
 
 		 868 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  33.81 
 
 		 830 aa  473  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  35.87 
 
 		 871 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  33.41 
 
 		 893 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.75 
 
 		 1037 aa  450  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  33.29 
 
 		 870 aa  433  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  34.76 
 
 		 884 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  31.87 
 
 		 887 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  35.19 
 
 		 918 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  33.93 
 
 		 877 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  32.83 
 
 		 1062 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  29.93 
 
 		 819 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  32.85 
 
 		 828 aa  355  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  31.8 
 
 		 817 aa  348  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.56 
 
 		 861 aa  333  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  30.58 
 
 		 859 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.98 
 
 		 811 aa  280  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  32.07 
 
 		 923 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  26.62 
 
 		 887 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  26.05 
 
 		 931 aa  258  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  35.45 
 
 		 779 aa  253  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  36.88 
 
 		 810 aa  229  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  35.51 
 
 		 809 aa  229  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  35.51 
 
 		 809 aa  229  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  34.82 
 
 		 812 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  33.04 
 
 		 758 aa  224  4e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  32.82 
 
 		 758 aa  224  6e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  31.96 
 
 		 794 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  31.68 
 
 		 824 aa  221  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  31.94 
 
 		 758 aa  221  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  35.79 
 
 		 804 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  31.38 
 
 		 815 aa  218  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  34.08 
 
 		 754 aa  218  4e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  36.29 
 
 		 810 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  34.72 
 
 		 800 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  34.97 
 
 		 781 aa  210  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  34.52 
 
 		 798 aa  207  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.33 
 
 		 869 aa  207  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  32.62 
 
 		 769 aa  206  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  28.29 
 
 		 789 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 789 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 789 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  32.75 
 
 		 790 aa  204  6e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 789 aa  204  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  33.67 
 
 		 805 aa  204  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  35.36 
 
 		 789 aa  203  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  32.42 
 
 		 789 aa  201  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  32.42 
 
 		 789 aa  201  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.06 
 
 		 810 aa  201  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  31.79 
 
 		 758 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  31.93 
 
 		 762 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  30.86 
 
 		 757 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  32.19 
 
 		 815 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  32.2 
 
 		 789 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  32.9 
 
 		 790 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 792 aa  199  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 809 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  32.2 
 
 		 789 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  32.89 
 
 		 762 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  31.79 
 
 		 758 aa  197  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  32.9 
 
 		 790 aa  197  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  31.33 
 
 		 790 aa  197  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  33.19 
 
 		 801 aa  196  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  31.14 
 
 		 790 aa  196  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  32.51 
 
 		 758 aa  196  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1744  phosphoenolpyruvate synthase  34.16 
 
 		 791 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 803 aa  196  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  30.7 
 
 		 778 aa  195  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 788 aa  195  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  31.7 
 
 		 795 aa  194  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  31.09 
 
 		 808 aa  195  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  34.33 
 
 		 799 aa  194  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  30.82 
 
 		 789 aa  194  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  33.19 
 
 		 798 aa  194  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  31.37 
 
 		 795 aa  194  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  30.46 
 
 		 794 aa  194  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  29.7 
 
 		 805 aa  194  8e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  32.58 
 
 		 761 aa  194  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  31.43 
 
 		 789 aa  194  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3094  phosphoenolpyruvate synthase  31.28 
 
 		 803 aa  193  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421568  normal  0.0476664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  32.15 
 
 		 794 aa  193  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  31.72 
 
 		 795 aa  193  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  30.62 
 
 		 832 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  31.51 
 
 		 795 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  31.49 
 
 		 795 aa  192  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  32.98 
 
 		 792 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 792 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  31.32 
 
 		 758 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  32.62 
 
 		 791 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  32.98 
 
 		 792 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  31.91 
 
 		 790 aa  192  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  32.98 
 
 		 792 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  31.51 
 
 		 794 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  32.98 
 
 		 792 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  33.73 
 
 		 1115 aa  192  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>