More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1355 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  43.13 
 
 		 918 aa  702    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  40.42 
 
 		 871 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 870 aa  1804    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  53.69 
 
 		 893 aa  951    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  44.96 
 
 		 887 aa  756    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  43.92 
 
 		 884 aa  729    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  36.75 
 
 		 875 aa  544  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  35.93 
 
 		 887 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  37.29 
 
 		 931 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  36.27 
 
 		 853 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  34.72 
 
 		 868 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  33.77 
 
 		 868 aa  485  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  34.2 
 
 		 877 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.1 
 
 		 853 aa  458  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.85 
 
 		 830 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.46 
 
 		 869 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  33.29 
 
 		 898 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  32.97 
 
 		 1062 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.66 
 
 		 1037 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  31.12 
 
 		 817 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  30.52 
 
 		 828 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  28.18 
 
 		 819 aa  333  9e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.53 
 
 		 861 aa  333  9e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  27.95 
 
 		 859 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.87 
 
 		 811 aa  320  7e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  30.11 
 
 		 923 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  37.63 
 
 		 779 aa  279  2e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  34.01 
 
 		 781 aa  249  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  35.49 
 
 		 754 aa  240  8e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  33.4 
 
 		 794 aa  238  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  33.68 
 
 		 782 aa  234  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  34.99 
 
 		 824 aa  233  1e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 799 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 799 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 799 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  33.69 
 
 		 799 aa  231  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 799 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 799 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 799 aa  231  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 812 aa  231  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  33.69 
 
 		 800 aa  231  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  33.69 
 
 		 800 aa  231  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  33.69 
 
 		 800 aa  231  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  33.69 
 
 		 800 aa  231  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 800 aa  230  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 799 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 801 aa  229  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  32.48 
 
 		 801 aa  229  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 799 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 799 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  34.24 
 
 		 788 aa  225  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  34.88 
 
 		 762 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  33.69 
 
 		 795 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  32.55 
 
 		 795 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 795 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  35.86 
 
 		 790 aa  221  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  34.48 
 
 		 764 aa  221  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  33.83 
 
 		 785 aa  220  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  34.17 
 
 		 799 aa  219  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  34.97 
 
 		 780 aa  219  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 798 aa  219  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  35.14 
 
 		 787 aa  219  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 769 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  34.04 
 
 		 797 aa  218  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  32.34 
 
 		 801 aa  217  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  34.35 
 
 		 800 aa  217  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  29.52 
 
 		 866 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  33.63 
 
 		 794 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  31.82 
 
 		 758 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  32.39 
 
 		 757 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.01 
 
 		 810 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  33.04 
 
 		 790 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  33.55 
 
 		 789 aa  214  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  33.18 
 
 		 762 aa  213  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  31.36 
 
 		 758 aa  212  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  34.7 
 
 		 779 aa  213  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 796 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  34.22 
 
 		 795 aa  213  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  34.45 
 
 		 796 aa  212  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  33.4 
 
 		 801 aa  212  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  32.61 
 
 		 758 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  31.48 
 
 		 795 aa  211  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  33.56 
 
 		 790 aa  211  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  35.01 
 
 		 786 aa  210  8e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  32.97 
 
 		 758 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  34.39 
 
 		 803 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  32.91 
 
 		 791 aa  209  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 799 aa  209  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  31.03 
 
 		 758 aa  209  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  33.19 
 
 		 789 aa  208  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 778 aa  208  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  32.52 
 
 		 803 aa  207  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  32.78 
 
 		 796 aa  207  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  32.78 
 
 		 796 aa  207  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 794 aa  207  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  33.71 
 
 		 790 aa  207  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 784 aa  207  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  32.34 
 
 		 794 aa  207  8e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  34.61 
 
 		 799 aa  207  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  34.61 
 
 		 799 aa  207  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>