More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0649 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  42.33 
 
 		 871 aa  712    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  47.28 
 
 		 887 aa  828    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  46.18 
 
 		 918 aa  786    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 893 aa  1844    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  53.69 
 
 		 870 aa  940    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  49.26 
 
 		 884 aa  830    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  38.77 
 
 		 887 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  39.52 
 
 		 931 aa  599  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  38.56 
 
 		 875 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  38.32 
 
 		 868 aa  568  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  35.95 
 
 		 853 aa  548  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  37.05 
 
 		 868 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.6 
 
 		 869 aa  521  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  36.59 
 
 		 877 aa  492  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.71 
 
 		 853 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  33.29 
 
 		 830 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  33.41 
 
 		 898 aa  435  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  33.25 
 
 		 1062 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.67 
 
 		 1037 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  31.85 
 
 		 828 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  31.85 
 
 		 817 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  31.58 
 
 		 819 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.27 
 
 		 811 aa  348  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.31 
 
 		 861 aa  331  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  27.23 
 
 		 859 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  28.86 
 
 		 923 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  36.95 
 
 		 779 aa  277  5e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  34.99 
 
 		 824 aa  258  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  36.58 
 
 		 801 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  36.36 
 
 		 799 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  36.72 
 
 		 791 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  36.36 
 
 		 799 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  36.36 
 
 		 799 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  36.58 
 
 		 801 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  36.07 
 
 		 800 aa  254  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  35.85 
 
 		 800 aa  254  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  35.85 
 
 		 800 aa  254  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  35.85 
 
 		 800 aa  254  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  36.07 
 
 		 800 aa  253  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  34.72 
 
 		 794 aa  252  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 		 799 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  36.13 
 
 		 795 aa  249  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 		 799 aa  249  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 		 799 aa  249  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 		 799 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 		 799 aa  249  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 		 799 aa  249  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 		 812 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 		 799 aa  248  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  36.9 
 
 		 790 aa  246  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  36.99 
 
 		 794 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  36.46 
 
 		 789 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  35.59 
 
 		 801 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  35.43 
 
 		 809 aa  243  7.999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  36.36 
 
 		 794 aa  242  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  34.9 
 
 		 815 aa  241  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  34.99 
 
 		 791 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  35.7 
 
 		 794 aa  240  6.999999999999999e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  36.25 
 
 		 795 aa  240  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  36.25 
 
 		 795 aa  240  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  35.48 
 
 		 794 aa  239  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  35.67 
 
 		 795 aa  239  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  36.34 
 
 		 788 aa  238  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  37.12 
 
 		 799 aa  238  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  37.12 
 
 		 799 aa  238  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  35.13 
 
 		 790 aa  238  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  34.07 
 
 		 781 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  33.27 
 
 		 798 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  34.99 
 
 		 795 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  35.29 
 
 		 787 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  35.86 
 
 		 754 aa  234  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  35.13 
 
 		 796 aa  234  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  34.69 
 
 		 789 aa  233  9e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  34.68 
 
 		 796 aa  231  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  34.83 
 
 		 801 aa  231  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  33.62 
 
 		 799 aa  231  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  34.19 
 
 		 798 aa  231  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  35.31 
 
 		 789 aa  231  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  35.31 
 
 		 789 aa  231  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  35.31 
 
 		 789 aa  230  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  33.18 
 
 		 757 aa  230  9e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  35.98 
 
 		 803 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  35.4 
 
 		 778 aa  230  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  35.1 
 
 		 789 aa  229  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  33.62 
 
 		 797 aa  229  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  33.83 
 
 		 799 aa  229  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 		 790 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  35.48 
 
 		 789 aa  227  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  35.19 
 
 		 791 aa  227  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  33.73 
 
 		 799 aa  226  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  34.9 
 
 		 795 aa  226  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  34.39 
 
 		 796 aa  226  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 791 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 791 aa  226  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  33.6 
 
 		 803 aa  226  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  34.39 
 
 		 796 aa  226  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  35.19 
 
 		 792 aa  225  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  34.67 
 
 		 789 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  34.67 
 
 		 789 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  34.67 
 
 		 789 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>