More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0708 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 923 aa  1812    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  32.56 
 
 		 868 aa  352  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  32.97 
 
 		 853 aa  336  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  30.4 
 
 		 875 aa  335  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.37 
 
 		 853 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  29.89 
 
 		 870 aa  325  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.64 
 
 		 1037 aa  321  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  32.12 
 
 		 868 aa  320  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  29.35 
 
 		 893 aa  320  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  32.13 
 
 		 1062 aa  317  7e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.58 
 
 		 830 aa  303  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  30.24 
 
 		 887 aa  300  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  31.37 
 
 		 877 aa  296  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  31.31 
 
 		 817 aa  294  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  31.46 
 
 		 898 aa  293  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  30.53 
 
 		 871 aa  291  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  30.9 
 
 		 918 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  31.17 
 
 		 819 aa  283  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  31.44 
 
 		 884 aa  282  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  32.38 
 
 		 828 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.22 
 
 		 811 aa  251  4e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  31.64 
 
 		 859 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.25 
 
 		 861 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  29.92 
 
 		 758 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  30.12 
 
 		 758 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  28.96 
 
 		 758 aa  193  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  30.27 
 
 		 769 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  33.95 
 
 		 760 aa  191  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  29.58 
 
 		 758 aa  191  7e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  29.53 
 
 		 758 aa  190  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 785 aa  189  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  26.57 
 
 		 887 aa  189  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  32.27 
 
 		 799 aa  189  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  29.73 
 
 		 761 aa  188  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  32.37 
 
 		 781 aa  187  7e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  28.75 
 
 		 757 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  31.3 
 
 		 780 aa  185  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  29.11 
 
 		 754 aa  186  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  32.48 
 
 		 810 aa  185  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  29.28 
 
 		 779 aa  183  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  31.42 
 
 		 785 aa  183  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  29.39 
 
 		 824 aa  183  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  29.51 
 
 		 812 aa  182  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  31.35 
 
 		 762 aa  183  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  30.64 
 
 		 809 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  27.34 
 
 		 931 aa  182  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  28.12 
 
 		 758 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  29.88 
 
 		 782 aa  179  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  28.82 
 
 		 788 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  32.06 
 
 		 809 aa  173  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  29.81 
 
 		 761 aa  171  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  29.21 
 
 		 762 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  32.79 
 
 		 787 aa  165  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.5 
 
 		 810 aa  166  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  27.62 
 
 		 764 aa  164  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  27.22 
 
 		 794 aa  158  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  29.34 
 
 		 795 aa  157  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  30.56 
 
 		 825 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  29.12 
 
 		 795 aa  155  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  31.33 
 
 		 792 aa  154  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  27.06 
 
 		 794 aa  152  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  29.23 
 
 		 790 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  29.86 
 
 		 791 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  30.06 
 
 		 792 aa  151  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  26.88 
 
 		 758 aa  151  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  29.15 
 
 		 796 aa  151  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  29.1 
 
 		 790 aa  150  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  30.33 
 
 		 806 aa  150  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 		 794 aa  150  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  29.65 
 
 		 791 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  29.94 
 
 		 792 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  28.98 
 
 		 790 aa  150  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  30.04 
 
 		 798 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  28.07 
 
 		 795 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  30.27 
 
 		 792 aa  149  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.12 
 
 		 887 aa  149  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  30.27 
 
 		 792 aa  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  28.49 
 
 		 797 aa  148  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  28.34 
 
 		 790 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  30.43 
 
 		 792 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  29.74 
 
 		 792 aa  148  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  29.74 
 
 		 792 aa  148  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  29.74 
 
 		 792 aa  148  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  29.74 
 
 		 792 aa  148  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  29.65 
 
 		 791 aa  148  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  29.74 
 
 		 792 aa  148  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  28.12 
 
 		 794 aa  147  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  28.12 
 
 		 794 aa  147  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  28.12 
 
 		 794 aa  147  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  29.51 
 
 		 791 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  32.72 
 
 		 786 aa  147  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  29.67 
 
 		 792 aa  146  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  28.85 
 
 		 803 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  30.06 
 
 		 792 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  30.06 
 
 		 792 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  28.33 
 
 		 799 aa  146  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  29.5 
 
 		 815 aa  146  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  28.68 
 
 		 800 aa  146  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  29.53 
 
 		 792 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  26.98 
 
 		 795 aa  145  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>