More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2044 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  100 
 
 		 830 aa  1711    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  43.87 
 
 		 868 aa  715    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  37.84 
 
 		 875 aa  561  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  36.08 
 
 		 868 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  36.12 
 
 		 853 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  34.42 
 
 		 887 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.11 
 
 		 853 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  33.61 
 
 		 898 aa  458  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  36.18 
 
 		 1062 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  32.85 
 
 		 870 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  33.29 
 
 		 893 aa  442  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.57 
 
 		 1037 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  34.38 
 
 		 877 aa  426  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  32.36 
 
 		 884 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  32.08 
 
 		 871 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  31.44 
 
 		 918 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  32.54 
 
 		 828 aa  345  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  30.92 
 
 		 817 aa  340  8e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  30.99 
 
 		 859 aa  333  6e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  30.06 
 
 		 819 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.64 
 
 		 811 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.61 
 
 		 861 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  38.57 
 
 		 781 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  37.86 
 
 		 779 aa  274  6e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  38.5 
 
 		 754 aa  268  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  35.61 
 
 		 824 aa  267  5e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  30.67 
 
 		 923 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  37.2 
 
 		 782 aa  264  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  26.48 
 
 		 887 aa  256  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  35.31 
 
 		 769 aa  251  5e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  36.71 
 
 		 762 aa  249  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  35.06 
 
 		 764 aa  248  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  32.03 
 
 		 758 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  34.66 
 
 		 758 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  34.35 
 
 		 758 aa  241  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  26.94 
 
 		 931 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  34.35 
 
 		 758 aa  239  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  35.87 
 
 		 761 aa  238  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  33.85 
 
 		 758 aa  238  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  34.51 
 
 		 788 aa  238  4e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  31.26 
 
 		 758 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  35.52 
 
 		 761 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  33.46 
 
 		 799 aa  234  7.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  35.28 
 
 		 794 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  34.1 
 
 		 786 aa  232  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  35.06 
 
 		 795 aa  231  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  35.06 
 
 		 795 aa  231  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 794 aa  231  6e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  34.83 
 
 		 795 aa  230  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  32.03 
 
 		 758 aa  230  8e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  36.53 
 
 		 760 aa  230  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 		 780 aa  230  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  35.43 
 
 		 800 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  35.43 
 
 		 800 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  35.43 
 
 		 800 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  31.34 
 
 		 791 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  34.67 
 
 		 794 aa  228  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  32.14 
 
 		 757 aa  227  6e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  33.6 
 
 		 785 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  31.84 
 
 		 797 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  34.98 
 
 		 800 aa  226  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 785 aa  225  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  35.35 
 
 		 799 aa  226  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  35.27 
 
 		 762 aa  225  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  35.27 
 
 		 798 aa  225  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  33.46 
 
 		 796 aa  225  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  33.46 
 
 		 796 aa  225  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  34.79 
 
 		 796 aa  224  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 787 aa  224  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 		 799 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  33.62 
 
 		 812 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  35.12 
 
 		 799 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  35.12 
 
 		 799 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 		 799 aa  222  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 		 799 aa  222  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 		 799 aa  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 		 799 aa  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 		 799 aa  222  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 		 799 aa  222  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  35.4 
 
 		 801 aa  221  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  33.62 
 
 		 799 aa  220  8.999999999999998e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  33.62 
 
 		 790 aa  220  8.999999999999998e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  33.18 
 
 		 796 aa  220  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  33.63 
 
 		 795 aa  220  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 799 aa  219  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 801 aa  219  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  29.89 
 
 		 795 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  32.16 
 
 		 792 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 760 aa  218  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  32.68 
 
 		 790 aa  218  4e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  32.2 
 
 		 799 aa  218  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  32.29 
 
 		 794 aa  218  5e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  33.77 
 
 		 799 aa  217  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  32.29 
 
 		 794 aa  216  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  32.58 
 
 		 801 aa  215  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1816  phosphoenolpyruvate synthase  33.62 
 
 		 803 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1493  phosphoenolpyruvate synthase  33.62 
 
 		 803 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.514917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 803 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  33.18 
 
 		 800 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  33.13 
 
 		 798 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>