More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0705 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 877 aa  1791    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  38.07 
 
 		 868 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  36.59 
 
 		 893 aa  501  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  36.14 
 
 		 875 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  37.09 
 
 		 853 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  35.55 
 
 		 868 aa  480  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  34.2 
 
 		 870 aa  459  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.38 
 
 		 830 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  36.36 
 
 		 884 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  34.26 
 
 		 918 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  32.82 
 
 		 887 aa  412  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  32.13 
 
 		 871 aa  395  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.05 
 
 		 853 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  34.29 
 
 		 898 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.97 
 
 		 1037 aa  365  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  33.76 
 
 		 1062 aa  365  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  30.35 
 
 		 817 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  30.84 
 
 		 828 aa  297  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  29.59 
 
 		 859 aa  290  8e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.51 
 
 		 811 aa  289  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  28.69 
 
 		 819 aa  277  6e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  31 
 
 		 923 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.52 
 
 		 861 aa  266  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  26.91 
 
 		 887 aa  265  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  34.84 
 
 		 866 aa  257  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  27.53 
 
 		 931 aa  249  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  35.04 
 
 		 754 aa  232  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.94 
 
 		 869 aa  232  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  32.74 
 
 		 779 aa  222  3e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  34.85 
 
 		 800 aa  221  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  31.06 
 
 		 758 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  31.74 
 
 		 794 aa  217  7e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  31.45 
 
 		 758 aa  217  7e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  31.67 
 
 		 758 aa  217  9e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  34.7 
 
 		 795 aa  216  9.999999999999999e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  31.89 
 
 		 758 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  31.98 
 
 		 800 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  31.98 
 
 		 800 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  31.98 
 
 		 800 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  32.33 
 
 		 758 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  31.61 
 
 		 799 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  31.61 
 
 		 799 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  32.54 
 
 		 795 aa  213  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  31.42 
 
 		 800 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  35.63 
 
 		 790 aa  213  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  31.68 
 
 		 757 aa  212  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 799 aa  211  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 799 aa  211  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 799 aa  211  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 812 aa  211  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 769 aa  211  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 799 aa  211  4e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 799 aa  211  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 799 aa  211  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  31.61 
 
 		 799 aa  211  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 		 799 aa  211  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  33.4 
 
 		 794 aa  211  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  34.73 
 
 		 762 aa  210  9e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  33.2 
 
 		 794 aa  210  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  34.8 
 
 		 803 aa  209  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  31.06 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  33.63 
 
 		 801 aa  208  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  35.46 
 
 		 804 aa  208  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 		 800 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  33.4 
 
 		 794 aa  207  7e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  32.11 
 
 		 790 aa  207  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  32.52 
 
 		 798 aa  206  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  32.9 
 
 		 781 aa  206  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 761 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  32.83 
 
 		 824 aa  207  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  33.85 
 
 		 801 aa  206  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 791 aa  206  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 794 aa  206  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  33.64 
 
 		 761 aa  206  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  34.05 
 
 		 793 aa  205  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 788 aa  204  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  30.84 
 
 		 758 aa  204  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  34.48 
 
 		 790 aa  203  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  34 
 
 		 795 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 815 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  35.64 
 
 		 786 aa  202  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  33.83 
 
 		 796 aa  202  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  32.91 
 
 		 795 aa  201  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  31.1 
 
 		 790 aa  201  7e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  32.91 
 
 		 795 aa  201  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  32.7 
 
 		 789 aa  200  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  35.32 
 
 		 812 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  29.16 
 
 		 782 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  30.75 
 
 		 793 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  32.04 
 
 		 789 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  32.71 
 
 		 795 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  31.97 
 
 		 798 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  32.73 
 
 		 797 aa  199  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 796 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  33.63 
 
 		 809 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 796 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  32.48 
 
 		 789 aa  198  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  33.84 
 
 		 787 aa  198  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 810 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  32.86 
 
 		 796 aa  197  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>