More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2187 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  53.41 
 
 		 828 aa  870    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 861 aa  1732    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  56.29 
 
 		 859 aa  952    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  40.28 
 
 		 817 aa  569  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  37.66 
 
 		 811 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  32.75 
 
 		 868 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  33.53 
 
 		 1037 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  31.34 
 
 		 875 aa  352  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  32.71 
 
 		 871 aa  349  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  32.78 
 
 		 1062 aa  343  5e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  30.66 
 
 		 893 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  31.01 
 
 		 868 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  29.94 
 
 		 870 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.71 
 
 		 853 aa  332  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  29.31 
 
 		 887 aa  331  4e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  31.72 
 
 		 898 aa  327  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.95 
 
 		 830 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  32.32 
 
 		 884 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  29.44 
 
 		 853 aa  320  6e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  30.82 
 
 		 819 aa  311  5e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  30.96 
 
 		 918 aa  298  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  28.59 
 
 		 877 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  27.38 
 
 		 887 aa  247  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  30.53 
 
 		 923 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  28.22 
 
 		 931 aa  221  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.48 
 
 		 869 aa  187  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  31.91 
 
 		 769 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  32.07 
 
 		 801 aa  178  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  29.53 
 
 		 761 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  30.09 
 
 		 758 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  29.14 
 
 		 757 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  29.89 
 
 		 758 aa  174  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  31.5 
 
 		 800 aa  173  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  31.71 
 
 		 801 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  30.56 
 
 		 762 aa  172  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  33.75 
 
 		 779 aa  171  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  32.07 
 
 		 799 aa  170  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  32.07 
 
 		 799 aa  170  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  32.07 
 
 		 799 aa  170  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  32.07 
 
 		 799 aa  170  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  29.03 
 
 		 762 aa  170  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  32.07 
 
 		 799 aa  170  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  32.07 
 
 		 799 aa  170  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  31.71 
 
 		 799 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  29.22 
 
 		 758 aa  170  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  29.21 
 
 		 758 aa  170  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  32.14 
 
 		 801 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  32.07 
 
 		 812 aa  170  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  31.86 
 
 		 799 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  31.71 
 
 		 800 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  31.71 
 
 		 800 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  31.71 
 
 		 800 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  30.18 
 
 		 758 aa  167  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  31.13 
 
 		 796 aa  167  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  29.78 
 
 		 758 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  31.5 
 
 		 799 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  29.69 
 
 		 754 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  31.5 
 
 		 799 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  29.55 
 
 		 792 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  30.55 
 
 		 796 aa  166  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  29.01 
 
 		 795 aa  165  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  31.71 
 
 		 800 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  30.41 
 
 		 761 aa  165  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  31.22 
 
 		 797 aa  164  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  28.02 
 
 		 795 aa  164  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  29.98 
 
 		 758 aa  163  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  28.73 
 
 		 779 aa  163  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  32.33 
 
 		 790 aa  163  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  31.33 
 
 		 815 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  30.43 
 
 		 795 aa  162  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  30.23 
 
 		 788 aa  162  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  28.22 
 
 		 795 aa  161  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  30.71 
 
 		 784 aa  161  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  30.55 
 
 		 796 aa  161  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  30.55 
 
 		 796 aa  161  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  33.11 
 
 		 793 aa  161  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  30.06 
 
 		 795 aa  160  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  30.51 
 
 		 794 aa  160  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  30.02 
 
 		 795 aa  160  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  30.3 
 
 		 787 aa  160  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  29.57 
 
 		 798 aa  159  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  30.46 
 
 		 781 aa  158  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  29.87 
 
 		 797 aa  158  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  31.84 
 
 		 801 aa  158  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  30.21 
 
 		 794 aa  157  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  28.1 
 
 		 764 aa  157  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  30.92 
 
 		 790 aa  157  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0593  phosphoenolpyruvate synthase  30.51 
 
 		 799 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.230146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  29.75 
 
 		 795 aa  156  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  30.45 
 
 		 824 aa  156  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0548  phosphoenolpyruvate synthase  30.72 
 
 		 799 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.485187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  30.82 
 
 		 799 aa  155  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  29.06 
 
 		 792 aa  155  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  30.14 
 
 		 799 aa  155  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  29.06 
 
 		 792 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  29.06 
 
 		 792 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  29.06 
 
 		 792 aa  154  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  28.17 
 
 		 792 aa  153  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  28.17 
 
 		 792 aa  153  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  28.17 
 
 		 792 aa  153  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>