More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2045 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  44.96 
 
 		 870 aa  743    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 887 aa  1848    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  47.28 
 
 		 893 aa  828    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  42.25 
 
 		 884 aa  697    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  40.64 
 
 		 918 aa  633  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  38.75 
 
 		 871 aa  609  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  35.8 
 
 		 868 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  35.07 
 
 		 875 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  36.84 
 
 		 931 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  35.03 
 
 		 887 aa  497  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  34.87 
 
 		 853 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.42 
 
 		 830 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  34.12 
 
 		 868 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.52 
 
 		 853 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.38 
 
 		 869 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.99 
 
 		 1037 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  32.18 
 
 		 877 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  31.63 
 
 		 898 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  32.74 
 
 		 1062 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  30.78 
 
 		 828 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  31.52 
 
 		 817 aa  354  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  29.26 
 
 		 819 aa  346  8.999999999999999e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  28.4 
 
 		 859 aa  343  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.73 
 
 		 861 aa  331  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.05 
 
 		 811 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  29.91 
 
 		 923 aa  270  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  33.61 
 
 		 779 aa  244  5e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  31.45 
 
 		 754 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 781 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  31.84 
 
 		 824 aa  235  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  31.64 
 
 		 794 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  30.73 
 
 		 809 aa  223  9e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  33.19 
 
 		 782 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  33.55 
 
 		 764 aa  221  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  31.83 
 
 		 799 aa  217  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  31.47 
 
 		 795 aa  214  7.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  31.79 
 
 		 769 aa  213  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  31.22 
 
 		 762 aa  212  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  30.65 
 
 		 810 aa  212  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  32.92 
 
 		 760 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  30.39 
 
 		 815 aa  210  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  30.6 
 
 		 785 aa  208  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  31.21 
 
 		 791 aa  207  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  31.11 
 
 		 780 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  29.47 
 
 		 758 aa  206  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  30.66 
 
 		 757 aa  206  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  30.75 
 
 		 794 aa  205  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  29.69 
 
 		 866 aa  205  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  31.59 
 
 		 791 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  31.97 
 
 		 794 aa  204  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  29.61 
 
 		 758 aa  205  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  31.15 
 
 		 794 aa  204  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  31.01 
 
 		 790 aa  204  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  31.52 
 
 		 791 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  31.13 
 
 		 791 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  29.83 
 
 		 761 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  31.2 
 
 		 792 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  30.44 
 
 		 791 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  32.18 
 
 		 789 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  30.44 
 
 		 791 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  31.13 
 
 		 793 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  30.04 
 
 		 761 aa  201  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  30.8 
 
 		 809 aa  202  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  32.44 
 
 		 795 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  30.25 
 
 		 791 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  31.97 
 
 		 795 aa  200  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  31.21 
 
 		 791 aa  200  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  31.26 
 
 		 762 aa  200  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  30.8 
 
 		 788 aa  200  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  30.74 
 
 		 791 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  29.65 
 
 		 821 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  32.44 
 
 		 795 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  29.8 
 
 		 812 aa  198  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  29.07 
 
 		 758 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 		 793 aa  198  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  31.6 
 
 		 792 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  31.75 
 
 		 794 aa  197  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  30.58 
 
 		 790 aa  197  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  30.28 
 
 		 800 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  31.91 
 
 		 790 aa  196  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  32.02 
 
 		 758 aa  196  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  31.24 
 
 		 790 aa  196  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  30.69 
 
 		 797 aa  195  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  31.21 
 
 		 798 aa  195  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  30.06 
 
 		 758 aa  195  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  30.6 
 
 		 792 aa  194  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  30.29 
 
 		 758 aa  194  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  31.33 
 
 		 796 aa  194  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  29.9 
 
 		 789 aa  194  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  29.46 
 
 		 790 aa  193  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  31.43 
 
 		 796 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  31.43 
 
 		 796 aa  192  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  30.52 
 
 		 785 aa  192  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  32.78 
 
 		 786 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  28.89 
 
 		 803 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  31.52 
 
 		 810 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  29.3 
 
 		 758 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  31.41 
 
 		 804 aa  191  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  31.29 
 
 		 792 aa  191  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  31.98 
 
 		 799 aa  191  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>