More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1568 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 869 aa  1775    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  45.85 
 
 		 931 aa  721    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  48.03 
 
 		 887 aa  754    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  35.81 
 
 		 893 aa  528  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  36.78 
 
 		 884 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  34.43 
 
 		 918 aa  452  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  32.51 
 
 		 870 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  32.88 
 
 		 887 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  34.38 
 
 		 871 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  26.58 
 
 		 868 aa  283  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  27.13 
 
 		 853 aa  259  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  25.74 
 
 		 875 aa  257  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  27.16 
 
 		 868 aa  249  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  27.29 
 
 		 877 aa  237  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  27.07 
 
 		 1062 aa  237  9e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.75 
 
 		 830 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  26.38 
 
 		 828 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  25.9 
 
 		 817 aa  211  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.41 
 
 		 853 aa  208  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.29 
 
 		 1037 aa  202  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  26.75 
 
 		 898 aa  196  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.94 
 
 		 861 aa  193  9e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  24.46 
 
 		 819 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  25.36 
 
 		 859 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  31.61 
 
 		 866 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.79 
 
 		 811 aa  165  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  24.58 
 
 		 923 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  25.32 
 
 		 781 aa  112  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  24.07 
 
 		 805 aa  97.4  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  25.81 
 
 		 784 aa  94.7  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  24.53 
 
 		 758 aa  93.6  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  25.18 
 
 		 812 aa  93.2  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  26.02 
 
 		 809 aa  92.8  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  25.12 
 
 		 782 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  23.96 
 
 		 824 aa  92  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 		 809 aa  92  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  24.35 
 
 		 758 aa  91.3  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  22.55 
 
 		 801 aa  91.3  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  23.54 
 
 		 791 aa  90.9  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  21.38 
 
 		 779 aa  90.9  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  25.51 
 
 		 798 aa  90.9  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  26.3 
 
 		 810 aa  90.9  9e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  24.62 
 
 		 800 aa  90.9  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  25.51 
 
 		 799 aa  90.5  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  24.06 
 
 		 801 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  24.18 
 
 		 799 aa  90.1  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  23.57 
 
 		 800 aa  89.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  22.86 
 
 		 769 aa  89.7  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  23.79 
 
 		 799 aa  89.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  22.95 
 
 		 758 aa  89.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  23.08 
 
 		 799 aa  89.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  24.18 
 
 		 812 aa  88.6  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  24.18 
 
 		 799 aa  88.2  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  24.18 
 
 		 799 aa  88.2  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  24.18 
 
 		 799 aa  88.2  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  24.18 
 
 		 799 aa  88.2  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  24.18 
 
 		 799 aa  88.2  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  22.58 
 
 		 789 aa  88.2  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  24.18 
 
 		 799 aa  88.2  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  23.13 
 
 		 758 aa  88.6  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  25.27 
 
 		 788 aa  88.2  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  23.87 
 
 		 801 aa  87.8  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  23.84 
 
 		 799 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  23.08 
 
 		 800 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  24.89 
 
 		 809 aa  87.4  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  23.08 
 
 		 800 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  23.08 
 
 		 800 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  24.06 
 
 		 758 aa  86.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  23.09 
 
 		 790 aa  85.1  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  22.09 
 
 		 758 aa  84.7  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  24.17 
 
 		 794 aa  84  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  24.17 
 
 		 794 aa  84  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  24.19 
 
 		 812 aa  84  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  24.17 
 
 		 794 aa  84  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  21.57 
 
 		 762 aa  83.2  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  21.12 
 
 		 764 aa  83.2  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  24.58 
 
 		 792 aa  82  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  24.61 
 
 		 792 aa  81.3  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  21.98 
 
 		 793 aa  81.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  24.23 
 
 		 762 aa  80.9  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  24.17 
 
 		 797 aa  80.1  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  23.4 
 
 		 790 aa  79.7  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  24.13 
 
 		 792 aa  79.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  26.93 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  23.63 
 
 		 789 aa  78.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  23.16 
 
 		 796 aa  78.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 		 792 aa  78.2  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 		 792 aa  78.2  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  24.63 
 
 		 794 aa  77.8  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  23.87 
 
 		 795 aa  77.8  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  23.53 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  23.49 
 
 		 801 aa  77.8  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  23.26 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  23.82 
 
 		 794 aa  77.8  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>