More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1565 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 871 aa  1774    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  40.42 
 
 		 870 aa  648    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  51.27 
 
 		 918 aa  823    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  42.33 
 
 		 893 aa  712    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  51.8 
 
 		 884 aa  844    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  38.75 
 
 		 887 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  34.5 
 
 		 868 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  33.97 
 
 		 868 aa  462  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  34.57 
 
 		 887 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  34.78 
 
 		 875 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  33.64 
 
 		 853 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  35.64 
 
 		 898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  34.66 
 
 		 931 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.53 
 
 		 869 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.08 
 
 		 830 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.85 
 
 		 1037 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  32.13 
 
 		 877 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.75 
 
 		 853 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  32.02 
 
 		 817 aa  388  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.51 
 
 		 861 aa  342  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  31.15 
 
 		 1062 aa  336  9e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  31.33 
 
 		 828 aa  328  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  30.22 
 
 		 819 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  30.74 
 
 		 859 aa  322  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.54 
 
 		 811 aa  301  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  30.42 
 
 		 923 aa  265  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  32.68 
 
 		 779 aa  223  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  32.27 
 
 		 799 aa  221  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  32.27 
 
 		 799 aa  221  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  32.27 
 
 		 799 aa  221  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  32.27 
 
 		 799 aa  221  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  32.27 
 
 		 799 aa  221  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  32.27 
 
 		 799 aa  221  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  32.27 
 
 		 799 aa  221  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  32.27 
 
 		 812 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  33.19 
 
 		 795 aa  220  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  31.38 
 
 		 815 aa  220  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  32.98 
 
 		 795 aa  219  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  31.24 
 
 		 781 aa  216  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  31.97 
 
 		 798 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  31.63 
 
 		 799 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  31.42 
 
 		 800 aa  214  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  31 
 
 		 800 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  31 
 
 		 800 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  31 
 
 		 800 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  30.66 
 
 		 794 aa  213  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 795 aa  212  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  29.69 
 
 		 782 aa  212  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  32.05 
 
 		 794 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  30.79 
 
 		 799 aa  210  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  30.79 
 
 		 799 aa  210  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  32.77 
 
 		 801 aa  209  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  31.34 
 
 		 792 aa  208  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  31.34 
 
 		 792 aa  208  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  31.7 
 
 		 794 aa  208  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 		 779 aa  208  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  31.34 
 
 		 792 aa  208  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  31.34 
 
 		 792 aa  207  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  31.47 
 
 		 791 aa  207  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  31.34 
 
 		 792 aa  207  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  31.34 
 
 		 792 aa  207  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  31.34 
 
 		 792 aa  207  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  31.34 
 
 		 792 aa  207  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  31.71 
 
 		 800 aa  207  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  31.89 
 
 		 790 aa  207  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  31.71 
 
 		 801 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  31.13 
 
 		 797 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  31.75 
 
 		 754 aa  205  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  31.13 
 
 		 792 aa  205  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  31.28 
 
 		 796 aa  204  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  29.92 
 
 		 790 aa  203  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  32.26 
 
 		 792 aa  203  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  31.13 
 
 		 792 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  32.8 
 
 		 799 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  31 
 
 		 778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  31.69 
 
 		 796 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  32.27 
 
 		 790 aa  201  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  30.62 
 
 		 791 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  29.61 
 
 		 758 aa  201  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  30.04 
 
 		 789 aa  201  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  31.52 
 
 		 789 aa  200  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  30.96 
 
 		 789 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  32.26 
 
 		 797 aa  200  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  30.49 
 
 		 792 aa  200  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  30.92 
 
 		 792 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  30.92 
 
 		 792 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  31.97 
 
 		 801 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  30.47 
 
 		 791 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  30.92 
 
 		 792 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  30.04 
 
 		 790 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  30.47 
 
 		 791 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  30.92 
 
 		 792 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  34.45 
 
 		 810 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  31.7 
 
 		 796 aa  199  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1744  phosphoenolpyruvate synthase  30.69 
 
 		 791 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  30.29 
 
 		 789 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  28.82 
 
 		 758 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  31.12 
 
 		 790 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  29.02 
 
 		 758 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  30.53 
 
 		 789 aa  199  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>