More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0174 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  51.8 
 
 		 871 aa  859    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  43.92 
 
 		 870 aa  736    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  42.25 
 
 		 887 aa  709    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  49.65 
 
 		 893 aa  845    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  66.7 
 
 		 918 aa  1128    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 884 aa  1779    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  39.12 
 
 		 887 aa  545  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  36.03 
 
 		 875 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  40.18 
 
 		 931 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  37.51 
 
 		 853 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  37.31 
 
 		 868 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  35.48 
 
 		 868 aa  484  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36 
 
 		 869 aa  476  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  36.36 
 
 		 877 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.87 
 
 		 853 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  34.45 
 
 		 898 aa  425  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.36 
 
 		 830 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  36.8 
 
 		 1062 aa  422  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  33.33 
 
 		 1037 aa  388  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  33.05 
 
 		 817 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  33.37 
 
 		 828 aa  359  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.71 
 
 		 861 aa  328  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  30.25 
 
 		 819 aa  324  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  30.85 
 
 		 859 aa  301  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.25 
 
 		 811 aa  281  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  31.13 
 
 		 923 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  33.68 
 
 		 779 aa  235  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  31.49 
 
 		 794 aa  229  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  33.76 
 
 		 791 aa  220  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  32.09 
 
 		 782 aa  220  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  33.92 
 
 		 762 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  33.47 
 
 		 754 aa  213  9e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  29.07 
 
 		 758 aa  211  7e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  34.65 
 
 		 800 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  34.93 
 
 		 812 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  34.93 
 
 		 799 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  34.93 
 
 		 799 aa  209  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  34.93 
 
 		 799 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  34.93 
 
 		 799 aa  209  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  34.93 
 
 		 799 aa  209  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  34.93 
 
 		 799 aa  209  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  34.44 
 
 		 799 aa  209  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  29.84 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  34.65 
 
 		 799 aa  207  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  29.69 
 
 		 769 aa  207  8e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  34.23 
 
 		 799 aa  207  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  34.68 
 
 		 801 aa  207  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  34.23 
 
 		 799 aa  207  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  34.58 
 
 		 798 aa  207  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  33.2 
 
 		 781 aa  207  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  34.25 
 
 		 796 aa  206  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  33.4 
 
 		 799 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  34.23 
 
 		 800 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  34.47 
 
 		 801 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  36.01 
 
 		 812 aa  206  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  34.23 
 
 		 800 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  34.23 
 
 		 800 aa  206  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 		 801 aa  205  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  34.04 
 
 		 800 aa  204  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  34.14 
 
 		 800 aa  204  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  34.61 
 
 		 793 aa  204  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 788 aa  204  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  30.6 
 
 		 798 aa  203  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  34.16 
 
 		 795 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  33.99 
 
 		 790 aa  201  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  34.15 
 
 		 866 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  34.16 
 
 		 795 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 784 aa  201  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  29.48 
 
 		 758 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  32.29 
 
 		 797 aa  200  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  35.17 
 
 		 810 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  34.4 
 
 		 795 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  34.17 
 
 		 794 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  33.13 
 
 		 809 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  30.52 
 
 		 805 aa  198  3e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  33.75 
 
 		 796 aa  198  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 		 795 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  34.25 
 
 		 801 aa  197  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  30.79 
 
 		 758 aa  196  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  32.64 
 
 		 803 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  32.58 
 
 		 824 aa  196  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  32.8 
 
 		 785 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  32.93 
 
 		 785 aa  195  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  28.81 
 
 		 757 aa  195  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  32.93 
 
 		 805 aa  195  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  34.37 
 
 		 809 aa  194  5e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  33.77 
 
 		 792 aa  194  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  30.8 
 
 		 758 aa  194  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  33.95 
 
 		 794 aa  194  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  33.11 
 
 		 792 aa  194  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  33.2 
 
 		 780 aa  194  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  33.88 
 
 		 796 aa  194  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  33.88 
 
 		 796 aa  194  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  31.69 
 
 		 804 aa  193  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  35.08 
 
 		 806 aa  192  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.98 
 
 		 810 aa  192  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  31.8 
 
 		 792 aa  191  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  31.8 
 
 		 792 aa  191  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  32.79 
 
 		 815 aa  191  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  35.5 
 
 		 804 aa  190  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>