More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1990 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 931 aa  1877    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.1 
 
 		 869 aa  728    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  61.7 
 
 		 887 aa  1064    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  39.58 
 
 		 893 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  37.43 
 
 		 870 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  39.06 
 
 		 918 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  39.98 
 
 		 884 aa  532  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  36.92 
 
 		 887 aa  519  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  34.56 
 
 		 871 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  30.37 
 
 		 868 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  28.43 
 
 		 875 aa  332  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  30.61 
 
 		 853 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  26.23 
 
 		 868 aa  302  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.16 
 
 		 853 aa  280  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  29.63 
 
 		 1062 aa  275  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  27.5 
 
 		 817 aa  263  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  27.63 
 
 		 877 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.27 
 
 		 1037 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.81 
 
 		 830 aa  248  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  26.06 
 
 		 898 aa  240  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.12 
 
 		 861 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  27.5 
 
 		 828 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  26.16 
 
 		 819 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  25.36 
 
 		 859 aa  195  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.53 
 
 		 811 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  31.25 
 
 		 866 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  27.38 
 
 		 923 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  23.93 
 
 		 779 aa  122  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  28.31 
 
 		 762 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  22.8 
 
 		 758 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  23.42 
 
 		 769 aa  115  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  26.27 
 
 		 784 aa  115  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  22.57 
 
 		 758 aa  114  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  22.38 
 
 		 758 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  21.9 
 
 		 757 aa  111  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  26.11 
 
 		 797 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  24.36 
 
 		 824 aa  109  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  25.53 
 
 		 796 aa  108  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  25.53 
 
 		 796 aa  108  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  29.15 
 
 		 760 aa  107  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  24.51 
 
 		 781 aa  107  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  27.31 
 
 		 793 aa  105  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  24.64 
 
 		 796 aa  106  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  27.02 
 
 		 801 aa  105  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  24.72 
 
 		 754 aa  105  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  25.38 
 
 		 760 aa  105  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  25.15 
 
 		 801 aa  105  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  23.22 
 
 		 758 aa  105  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  24.89 
 
 		 796 aa  105  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  27.62 
 
 		 803 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  27.04 
 
 		 799 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  23.48 
 
 		 782 aa  102  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  25.87 
 
 		 790 aa  101  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  24.9 
 
 		 795 aa  101  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  25.92 
 
 		 794 aa  101  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  27.17 
 
 		 780 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  26.46 
 
 		 804 aa  100  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  25.05 
 
 		 798 aa  100  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  25.74 
 
 		 794 aa  100  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  24.9 
 
 		 761 aa  99.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  26.2 
 
 		 799 aa  99.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  26.2 
 
 		 799 aa  99.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  26.54 
 
 		 785 aa  99  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  28.41 
 
 		 805 aa  99  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  25.84 
 
 		 789 aa  98.6  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  26.82 
 
 		 792 aa  98.2  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  27.43 
 
 		 795 aa  98.2  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  29.36 
 
 		 800 aa  98.2  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  26.27 
 
 		 788 aa  97.8  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  22.29 
 
 		 794 aa  97.8  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  23.21 
 
 		 758 aa  97.8  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  24.73 
 
 		 809 aa  97.8  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  25.71 
 
 		 812 aa  97.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  25.83 
 
 		 794 aa  97.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  26.77 
 
 		 794 aa  97.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  25.83 
 
 		 794 aa  97.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  24.03 
 
 		 799 aa  97.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  26.79 
 
 		 786 aa  97.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  25.83 
 
 		 794 aa  97.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  26.69 
 
 		 785 aa  96.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  25.71 
 
 		 799 aa  96.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  27.7 
 
 		 810 aa  96.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  25.71 
 
 		 799 aa  96.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  25.71 
 
 		 799 aa  96.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  25.79 
 
 		 799 aa  96.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  25.71 
 
 		 799 aa  96.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  25.69 
 
 		 800 aa  96.3  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  24.66 
 
 		 789 aa  96.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  25.71 
 
 		 799 aa  96.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  25.71 
 
 		 799 aa  96.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  24.84 
 
 		 758 aa  97.1  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  28.44 
 
 		 795 aa  97.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  25.62 
 
 		 798 aa  95.9  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  25.57 
 
 		 791 aa  95.9  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  29.87 
 
 		 765 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  23.79 
 
 		 795 aa  95.9  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  23.45 
 
 		 809 aa  96.3  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  26.49 
 
 		 798 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3469  phosphoenolpyruvate synthase  26.49 
 
 		 798 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  28.53 
 
 		 799 aa  95.5  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>