More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2666 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  43.87 
 
 		 830 aa  715    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  40.64 
 
 		 875 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 868 aa  1777    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  38.8 
 
 		 868 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  38.45 
 
 		 853 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  38.32 
 
 		 893 aa  568  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  35.8 
 
 		 887 aa  530  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.57 
 
 		 853 aa  525  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  35.94 
 
 		 898 aa  497  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  36.8 
 
 		 1062 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  33.77 
 
 		 870 aa  476  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  35.55 
 
 		 1037 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  35.48 
 
 		 884 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  35.55 
 
 		 877 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  33.97 
 
 		 871 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  33.91 
 
 		 918 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  32.99 
 
 		 828 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.6 
 
 		 861 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  31.03 
 
 		 817 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  30.09 
 
 		 819 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  29.63 
 
 		 859 aa  346  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.13 
 
 		 811 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  32.56 
 
 		 923 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  27.43 
 
 		 887 aa  302  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  26.26 
 
 		 931 aa  287  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  39.38 
 
 		 769 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.6 
 
 		 869 aa  278  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  36.11 
 
 		 824 aa  274  6e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  36.6 
 
 		 757 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  36.54 
 
 		 754 aa  271  5e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  36.76 
 
 		 779 aa  269  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  35.17 
 
 		 758 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  35.73 
 
 		 758 aa  263  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  35.56 
 
 		 758 aa  261  6e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  37.12 
 
 		 781 aa  258  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  35.35 
 
 		 782 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  36.09 
 
 		 791 aa  252  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  36.36 
 
 		 796 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  39.51 
 
 		 797 aa  247  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  37.98 
 
 		 796 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  37.98 
 
 		 796 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  35.99 
 
 		 794 aa  245  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  35.99 
 
 		 792 aa  244  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  37.66 
 
 		 787 aa  243  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  35.56 
 
 		 794 aa  243  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  35.23 
 
 		 798 aa  242  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  36.48 
 
 		 786 aa  242  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  37.05 
 
 		 799 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  39.23 
 
 		 810 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  37.09 
 
 		 789 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  36.62 
 
 		 809 aa  239  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  38 
 
 		 815 aa  238  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  35.84 
 
 		 789 aa  237  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  36.08 
 
 		 789 aa  237  7e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  34.63 
 
 		 794 aa  237  8e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  36.36 
 
 		 795 aa  237  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  35.97 
 
 		 796 aa  237  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  36.17 
 
 		 795 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  36.36 
 
 		 795 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  37 
 
 		 790 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  36.26 
 
 		 795 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  34.77 
 
 		 758 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  36.48 
 
 		 798 aa  235  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  35.4 
 
 		 800 aa  234  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  35.79 
 
 		 799 aa  234  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  35.14 
 
 		 797 aa  234  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 799 aa  234  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 799 aa  234  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  34.48 
 
 		 790 aa  234  6e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 800 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 800 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  37.22 
 
 		 789 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 800 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 799 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  35.36 
 
 		 800 aa  233  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  34.29 
 
 		 758 aa  233  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  36.78 
 
 		 789 aa  233  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  36.82 
 
 		 794 aa  233  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  36.98 
 
 		 796 aa  233  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  34.88 
 
 		 790 aa  233  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 812 aa  233  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0593  phosphoenolpyruvate synthase  37.61 
 
 		 799 aa  232  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.230146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  36.5 
 
 		 790 aa  232  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  35.17 
 
 		 791 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2594  phosphoenolpyruvate synthase  34.84 
 
 		 812 aa  231  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  35.68 
 
 		 789 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  35.68 
 
 		 789 aa  231  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  33.4 
 
 		 803 aa  231  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  35.55 
 
 		 799 aa  231  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0548  phosphoenolpyruvate synthase  37.61 
 
 		 799 aa  231  6e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.485187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  35.21 
 
 		 792 aa  230  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  36.07 
 
 		 794 aa  230  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  35.47 
 
 		 789 aa  230  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  35.5 
 
 		 800 aa  229  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>