More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0151 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  61.75 
 
 		 931 aa  1032    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  47.33 
 
 		 869 aa  736    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 887 aa  1799    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  38.77 
 
 		 893 aa  616  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  38.88 
 
 		 918 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  35.93 
 
 		 870 aa  531  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  39.12 
 
 		 884 aa  532  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  35.03 
 
 		 887 aa  497  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  34.57 
 
 		 871 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  29.66 
 
 		 853 aa  345  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  28.36 
 
 		 875 aa  345  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  29.86 
 
 		 868 aa  336  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  27.43 
 
 		 868 aa  302  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  28.05 
 
 		 817 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  28.78 
 
 		 1062 aa  274  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.45 
 
 		 853 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.81 
 
 		 1037 aa  261  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  26.91 
 
 		 877 aa  261  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  26.39 
 
 		 819 aa  258  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.48 
 
 		 830 aa  256  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  26.38 
 
 		 898 aa  253  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  27.67 
 
 		 828 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.48 
 
 		 861 aa  243  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  25.95 
 
 		 859 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.96 
 
 		 811 aa  213  9e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  26.44 
 
 		 923 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0707  PEP-utilising protein mobile region  30.25 
 
 		 866 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454506 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  23.96 
 
 		 779 aa  114  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  24.9 
 
 		 784 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  23.81 
 
 		 824 aa  103  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  27.11 
 
 		 812 aa  103  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  27.43 
 
 		 803 aa  101  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  24.13 
 
 		 769 aa  101  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  23.95 
 
 		 809 aa  100  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  23.97 
 
 		 794 aa  99.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  27.29 
 
 		 804 aa  99.4  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  26.07 
 
 		 809 aa  99  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  25.42 
 
 		 809 aa  99.4  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.69 
 
 		 810 aa  99  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  24.9 
 
 		 789 aa  98.2  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  23.82 
 
 		 799 aa  98.2  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  25.54 
 
 		 781 aa  97.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  27.86 
 
 		 793 aa  96.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  23.18 
 
 		 754 aa  96.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  24.13 
 
 		 792 aa  96.3  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  24.95 
 
 		 799 aa  95.9  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  23.66 
 
 		 801 aa  95.5  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  24.73 
 
 		 795 aa  95.5  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  23.97 
 
 		 789 aa  94.7  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  27.02 
 
 		 793 aa  94.7  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  21.81 
 
 		 795 aa  94.7  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  24.69 
 
 		 789 aa  94.7  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  22.64 
 
 		 790 aa  94.4  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  24.07 
 
 		 800 aa  94.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  23.85 
 
 		 799 aa  94.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  24.51 
 
 		 799 aa  94.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  24.51 
 
 		 799 aa  94.4  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  24.51 
 
 		 799 aa  94.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  24.51 
 
 		 799 aa  94.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  23.85 
 
 		 799 aa  94.4  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  24.51 
 
 		 799 aa  94.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  24.51 
 
 		 799 aa  94.4  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  25.11 
 
 		 797 aa  94  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  24.51 
 
 		 812 aa  94  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  24.17 
 
 		 791 aa  94  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0548  phosphoenolpyruvate synthase  25.16 
 
 		 799 aa  93.6  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.485187  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  29.69 
 
 		 765 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  23.85 
 
 		 800 aa  93.2  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  23.69 
 
 		 798 aa  92.8  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  24.07 
 
 		 799 aa  93.2  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  23.19 
 
 		 789 aa  92.8  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  23.85 
 
 		 800 aa  93.2  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  25.64 
 
 		 801 aa  93.2  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  23.85 
 
 		 800 aa  93.2  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  24.35 
 
 		 801 aa  92.8  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  24.18 
 
 		 801 aa  92  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  23.91 
 
 		 800 aa  92  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  23.67 
 
 		 792 aa  92  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  23.63 
 
 		 790 aa  92  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  22.59 
 
 		 789 aa  92  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  25.67 
 
 		 798 aa  92  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  26.18 
 
 		 810 aa  91.7  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0593  phosphoenolpyruvate synthase  25.37 
 
 		 799 aa  91.7  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.230146  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  24.58 
 
 		 797 aa  90.5  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  25.06 
 
 		 762 aa  90.5  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  23.33 
 
 		 794 aa  90.5  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  21.33 
 
 		 758 aa  90.5  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  25.57 
 
 		 786 aa  90.5  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  23.54 
 
 		 794 aa  90.5  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  22.63 
 
 		 795 aa  90.1  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  23.57 
 
 		 794 aa  89.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  23.57 
 
 		 794 aa  89.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  23.57 
 
 		 794 aa  89.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  21.41 
 
 		 758 aa  89.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  24.85 
 
 		 790 aa  89.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  23.79 
 
 		 812 aa  89.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  25.32 
 
 		 796 aa  89  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  25.32 
 
 		 796 aa  89  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  24.45 
 
 		 796 aa  89.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  24.21 
 
 		 810 aa  88.2  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>