More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0630 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  49.36 
 
 		 868 aa  835    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  47.84 
 
 		 853 aa  805    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 875 aa  1794    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  40.64 
 
 		 868 aa  655    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.57 
 
 		 853 aa  716    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  38.56 
 
 		 893 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  37.84 
 
 		 830 aa  571  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  39.13 
 
 		 898 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  36.75 
 
 		 870 aa  548  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  35.07 
 
 		 887 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  36.3 
 
 		 884 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  35.06 
 
 		 918 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  36.14 
 
 		 877 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  34.78 
 
 		 871 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.05 
 
 		 1037 aa  466  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  34.55 
 
 		 1062 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  30.67 
 
 		 828 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  30.7 
 
 		 817 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  28.36 
 
 		 887 aa  354  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.55 
 
 		 861 aa  345  2e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  27.63 
 
 		 819 aa  340  9e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  28.25 
 
 		 931 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  28 
 
 		 859 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.84 
 
 		 811 aa  313  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  30.4 
 
 		 923 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  37.87 
 
 		 824 aa  292  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  37.55 
 
 		 779 aa  288  4e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  37.67 
 
 		 754 aa  277  6e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  36.82 
 
 		 758 aa  271  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 		 782 aa  271  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  35.68 
 
 		 758 aa  270  1e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  35.08 
 
 		 758 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  35.27 
 
 		 769 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  36.78 
 
 		 781 aa  262  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.68 
 
 		 869 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  36.09 
 
 		 794 aa  258  3e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  34.62 
 
 		 757 aa  256  9e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  34.92 
 
 		 758 aa  248  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  37.58 
 
 		 809 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  36.64 
 
 		 793 aa  246  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  34.97 
 
 		 758 aa  245  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  36.34 
 
 		 812 aa  243  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  35.17 
 
 		 758 aa  242  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  37.84 
 
 		 809 aa  242  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  37.86 
 
 		 810 aa  242  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  35.13 
 
 		 795 aa  242  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  36.18 
 
 		 789 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  37.06 
 
 		 790 aa  241  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  34 
 
 		 761 aa  241  5e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  35.45 
 
 		 800 aa  241  5.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  35.02 
 
 		 795 aa  240  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  35.39 
 
 		 786 aa  240  9e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  34.6 
 
 		 795 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 		 795 aa  239  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  34.83 
 
 		 780 aa  238  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  34.56 
 
 		 794 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  34.97 
 
 		 790 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  33.19 
 
 		 801 aa  235  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  34.56 
 
 		 758 aa  234  5e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 		 798 aa  234  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  34.05 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  34.05 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  34.1 
 
 		 785 aa  232  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  34.46 
 
 		 799 aa  233  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  33.84 
 
 		 800 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  32.73 
 
 		 788 aa  232  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  33.95 
 
 		 806 aa  232  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  33.84 
 
 		 800 aa  232  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  33.84 
 
 		 800 aa  232  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  33.84 
 
 		 800 aa  232  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  35.5 
 
 		 787 aa  231  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  35.58 
 
 		 804 aa  230  9e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 800 aa  230  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  33.68 
 
 		 789 aa  229  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 801 aa  229  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  34.18 
 
 		 785 aa  229  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 799 aa  229  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  35.7 
 
 		 797 aa  229  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  33.69 
 
 		 791 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  34.05 
 
 		 794 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  32.76 
 
 		 832 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  32.99 
 
 		 809 aa  228  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  32.89 
 
 		 761 aa  228  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  35.75 
 
 		 815 aa  228  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  34.19 
 
 		 801 aa  228  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  34.1 
 
 		 792 aa  228  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  34.1 
 
 		 792 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  34.1 
 
 		 792 aa  227  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  34.1 
 
 		 792 aa  227  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  34.1 
 
 		 792 aa  227  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  34.1 
 
 		 792 aa  227  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  34.1 
 
 		 792 aa  227  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  34.1 
 
 		 792 aa  227  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  34.1 
 
 		 792 aa  227  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  33.53 
 
 		 792 aa  227  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 		 797 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 		 801 aa  226  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  34.31 
 
 		 760 aa  225  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  32.84 
 
 		 799 aa  226  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 		 789 aa  226  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>