More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1946 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 1115 aa  2243    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  42.38 
 
 		 803 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 		 812 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  37.94 
 
 		 793 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  39.04 
 
 		 793 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  39.64 
 
 		 794 aa  499  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  39.7 
 
 		 804 aa  499  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  39.81 
 
 		 787 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  38.82 
 
 		 791 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  38.89 
 
 		 799 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  37.53 
 
 		 825 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  38.89 
 
 		 799 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  38.62 
 
 		 803 aa  493  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  40.55 
 
 		 790 aa  491  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  40.72 
 
 		 800 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  39.52 
 
 		 799 aa  489  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  37.69 
 
 		 794 aa  489  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  38.82 
 
 		 791 aa  489  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  38.7 
 
 		 791 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 		 791 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  38.87 
 
 		 795 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  36.97 
 
 		 790 aa  484  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  38.28 
 
 		 791 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  38.28 
 
 		 791 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  38.72 
 
 		 803 aa  485  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3585  phosphoenolpyruvate synthase  37.21 
 
 		 812 aa  483  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.737105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  38.18 
 
 		 789 aa  485  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  37.33 
 
 		 809 aa  483  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  38.9 
 
 		 791 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  37.89 
 
 		 798 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  38.85 
 
 		 790 aa  482  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  38.56 
 
 		 795 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  38.84 
 
 		 791 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  39.31 
 
 		 795 aa  480  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  38.55 
 
 		 801 aa  480  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  38.33 
 
 		 795 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  39.2 
 
 		 778 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  38.62 
 
 		 797 aa  478  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  39.13 
 
 		 794 aa  479  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  38.7 
 
 		 789 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  38.7 
 
 		 790 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  37.35 
 
 		 837 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  38.02 
 
 		 790 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  37.75 
 
 		 788 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 		 832 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  39.93 
 
 		 810 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 		 799 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 		 799 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  37.25 
 
 		 790 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  38.56 
 
 		 792 aa  475  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  38.62 
 
 		 800 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0781  phosphoenolpyruvate synthase  38.6 
 
 		 838 aa  476  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.166305 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  38.32 
 
 		 799 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 		 799 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  37.32 
 
 		 794 aa  474  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  38.9 
 
 		 793 aa  474  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  38.62 
 
 		 800 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 		 799 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 		 812 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  38.62 
 
 		 800 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  38.48 
 
 		 799 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 		 799 aa  475  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  38.51 
 
 		 799 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  38.28 
 
 		 821 aa  475  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  38.84 
 
 		 805 aa  473  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  37.88 
 
 		 795 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  37.9 
 
 		 792 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  36.82 
 
 		 794 aa  472  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  36.8 
 
 		 821 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  38.65 
 
 		 800 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 		 795 aa  472  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  38.96 
 
 		 803 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  38.37 
 
 		 825 aa  473  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  38.52 
 
 		 800 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  36.43 
 
 		 839 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  38.18 
 
 		 792 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  36.43 
 
 		 839 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  38.35 
 
 		 815 aa  473  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  39.67 
 
 		 812 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  38.3 
 
 		 791 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 		 799 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  38.74 
 
 		 801 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  38.49 
 
 		 758 aa  468  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  38.09 
 
 		 796 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  37.2 
 
 		 815 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  37.22 
 
 		 789 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  37.22 
 
 		 789 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  38.23 
 
 		 799 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  38.65 
 
 		 806 aa  469  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1744  phosphoenolpyruvate synthase  37.59 
 
 		 791 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  38.23 
 
 		 799 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1972  phosphoenolpyruvate synthase  39.26 
 
 		 805 aa  469  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  37.22 
 
 		 789 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  37.66 
 
 		 789 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  38.41 
 
 		 801 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  37.21 
 
 		 789 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  36.85 
 
 		 789 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  37.16 
 
 		 819 aa  466  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  37.34 
 
 		 789 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3406  phosphoenolpyruvate synthase  38.19 
 
 		 798 aa  465  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>