More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4143 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  97.51 
 
 		 885 aa  1701    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 885 aa  1785    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.99 
 
 		 868 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0682  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  31.78 
 
 		 873 aa  293  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.32 
 
 		 873 aa  267  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  26.79 
 
 		 890 aa  267  5.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.93 
 
 		 891 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.26 
 
 		 903 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.62 
 
 		 869 aa  230  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  29.27 
 
 		 886 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.78 
 
 		 889 aa  205  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.67 
 
 		 884 aa  202  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  42.76 
 
 		 971 aa  193  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.59 
 
 		 887 aa  193  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.3 
 
 		 852 aa  192  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  38.36 
 
 		 870 aa  191  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  29.43 
 
 		 791 aa  189  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  33.73 
 
 		 891 aa  188  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  35.29 
 
 		 871 aa  184  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  34.41 
 
 		 758 aa  182  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  34.08 
 
 		 758 aa  181  7e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  34.08 
 
 		 758 aa  181  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  38.93 
 
 		 760 aa  180  9e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 		 761 aa  177  9e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  34.74 
 
 		 868 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  32.46 
 
 		 866 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.24 
 
 		 840 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  34.74 
 
 		 868 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.16 
 
 		 902 aa  173  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 		 788 aa  172  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 868 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 868 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  37.1 
 
 		 366 aa  172  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  25.96 
 
 		 854 aa  172  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  32.13 
 
 		 868 aa  171  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  35.01 
 
 		 799 aa  171  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  36.04 
 
 		 865 aa  170  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  33.44 
 
 		 869 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  34.11 
 
 		 825 aa  169  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  33.24 
 
 		 868 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 		 780 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  36.01 
 
 		 892 aa  168  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  34.51 
 
 		 871 aa  167  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.58 
 
 		 887 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  38.58 
 
 		 907 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  33.04 
 
 		 868 aa  165  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  27.35 
 
 		 788 aa  165  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  34.41 
 
 		 762 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  35.55 
 
 		 785 aa  164  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  35.23 
 
 		 785 aa  163  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  32.16 
 
 		 868 aa  162  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  35.2 
 
 		 754 aa  161  6e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  37.25 
 
 		 765 aa  160  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  32.46 
 
 		 757 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  33.77 
 
 		 869 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.59 
 
 		 835 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  33.01 
 
 		 764 aa  158  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  35.78 
 
 		 778 aa  158  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  36.1 
 
 		 793 aa  156  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  34.09 
 
 		 781 aa  156  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  33.23 
 
 		 359 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  32.44 
 
 		 758 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  32.46 
 
 		 769 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  32.89 
 
 		 761 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  31.48 
 
 		 758 aa  155  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  34.3 
 
 		 790 aa  155  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  33.96 
 
 		 798 aa  154  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.25 
 
 		 950 aa  154  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  31.48 
 
 		 758 aa  153  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  31.15 
 
 		 758 aa  152  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  34.95 
 
 		 810 aa  151  5e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  31.4 
 
 		 874 aa  151  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  34.56 
 
 		 792 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  34.56 
 
 		 791 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 824 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  33.75 
 
 		 791 aa  149  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  34.4 
 
 		 790 aa  149  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  32.76 
 
 		 906 aa  148  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  34.85 
 
 		 790 aa  147  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 809 aa  147  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  32.85 
 
 		 787 aa  147  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  22.89 
 
 		 971 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 791 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  33.64 
 
 		 790 aa  146  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  23.09 
 
 		 971 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  33.76 
 
 		 853 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  34.24 
 
 		 795 aa  145  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 791 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  27.56 
 
 		 725 aa  145  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  33.95 
 
 		 868 aa  144  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  34.15 
 
 		 803 aa  144  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  32.69 
 
 		 782 aa  144  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  33.64 
 
 		 791 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 791 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3011  phosphoenolpyruvate synthase  32.85 
 
 		 795 aa  144  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  34.27 
 
 		 795 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  37.31 
 
 		 867 aa  143  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  37.54 
 
 		 275 aa  144  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 791 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  34.78 
 
 		 800 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>