More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2728 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  61.1 
 
 
868 aa  1133    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  60.64 
 
 
868 aa  1141    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  61.33 
 
 
868 aa  1136    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  60.87 
 
 
868 aa  1135    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  60.76 
 
 
869 aa  1120    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  48.34 
 
 
842 aa  875    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  60.64 
 
 
868 aa  1130    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  45.9 
 
 
890 aa  773    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  42.32 
 
 
837 aa  701    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  56.37 
 
 
870 aa  1007    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  54.35 
 
 
865 aa  993    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  58.24 
 
 
866 aa  1061    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  61.33 
 
 
868 aa  1136    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  60.41 
 
 
869 aa  1125    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  60.53 
 
 
868 aa  1119    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  53.14 
 
 
871 aa  962    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  60.64 
 
 
868 aa  1122    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
874 aa  1796    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.98 
 
 
887 aa  621  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  40.42 
 
 
891 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.48 
 
 
903 aa  457  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.05 
 
 
873 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.79 
 
 
887 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  33.84 
 
 
907 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.46 
 
 
950 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.64 
 
 
867 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  30.69 
 
 
826 aa  361  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  29.65 
 
 
906 aa  350  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0174  phosphoenolpyruvate synthase  50.31 
 
 
341 aa  343  8e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.466875  normal  0.4987 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.38 
 
 
891 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  30.53 
 
 
971 aa  306  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.67 
 
 
821 aa  303  9e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  28.13 
 
 
886 aa  303  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.43 
 
 
869 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  28.16 
 
 
825 aa  286  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.87 
 
 
889 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  42.49 
 
 
758 aa  251  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  43.34 
 
 
781 aa  248  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  44.14 
 
 
824 aa  242  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  43.69 
 
 
782 aa  239  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  41.56 
 
 
769 aa  226  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  40.87 
 
 
785 aa  224  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  39.44 
 
 
754 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  38.54 
 
 
761 aa  224  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  40.94 
 
 
788 aa  224  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  38.22 
 
 
762 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  41.72 
 
 
780 aa  222  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  42.36 
 
 
785 aa  221  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  38.07 
 
 
758 aa  219  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  40.82 
 
 
762 aa  219  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  42.02 
 
 
764 aa  219  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  38.91 
 
 
758 aa  219  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  39.01 
 
 
758 aa  217  7e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  40.48 
 
 
799 aa  215  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  39.02 
 
 
757 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  36.73 
 
 
812 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  38.23 
 
 
809 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  37.26 
 
 
761 aa  211  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  41.25 
 
 
835 aa  211  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  37.27 
 
 
809 aa  211  6e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.62 
 
 
840 aa  208  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  38.36 
 
 
758 aa  207  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  37.74 
 
 
810 aa  206  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  25.16 
 
 
788 aa  206  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.73 
 
 
902 aa  205  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  39.67 
 
 
760 aa  205  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  38.48 
 
 
790 aa  205  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  38.03 
 
 
758 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  37.35 
 
 
786 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  38.03 
 
 
758 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  38.32 
 
 
779 aa  201  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  38.32 
 
 
892 aa  201  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  38.25 
 
 
794 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  37.78 
 
 
334 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  35.83 
 
 
364 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.46 
 
 
302 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  37.76 
 
 
801 aa  197  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.24 
 
 
852 aa  197  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  24.83 
 
 
791 aa  197  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  38.25 
 
 
795 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  38.39 
 
 
382 aa  197  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  36.28 
 
 
821 aa  195  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  37.95 
 
 
794 aa  192  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  36.53 
 
 
808 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  36.34 
 
 
799 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  37.35 
 
 
800 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  37.69 
 
 
795 aa  192  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  36.34 
 
 
799 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  38.25 
 
 
795 aa  191  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  37.05 
 
 
794 aa  190  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  38.74 
 
 
798 aa  190  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  37.43 
 
 
789 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.18 
 
 
971 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  36.14 
 
 
800 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  36.14 
 
 
800 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  36.14 
 
 
801 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  38.25 
 
 
795 aa  189  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  36.14 
 
 
800 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  35.91 
 
 
793 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  36.09 
 
 
798 aa  189  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>