More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1010 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  100 
 
 
725 aa  1478    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2917  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  48.35 
 
 
692 aa  616  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  38.65 
 
 
726 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.55 
 
 
840 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  32.47 
 
 
761 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.6 
 
 
887 aa  159  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  32.59 
 
 
762 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.63 
 
 
902 aa  155  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  35.81 
 
 
760 aa  153  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  29.65 
 
 
781 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  28.57 
 
 
758 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  30.3 
 
 
764 aa  143  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.65 
 
 
873 aa  143  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  30.74 
 
 
761 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.98 
 
 
950 aa  140  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  30.19 
 
 
762 aa  140  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  30.52 
 
 
785 aa  140  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  28.8 
 
 
758 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  30.9 
 
 
788 aa  139  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  32.92 
 
 
907 aa  139  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  29.93 
 
 
754 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  30.06 
 
 
799 aa  138  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  26.97 
 
 
757 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  33.45 
 
 
971 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  29.24 
 
 
825 aa  137  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  29.36 
 
 
780 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.21 
 
 
887 aa  136  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  29.22 
 
 
871 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  27.18 
 
 
758 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.41 
 
 
302 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  28.9 
 
 
769 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  29.13 
 
 
758 aa  134  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.74 
 
 
891 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  30.13 
 
 
334 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  29.66 
 
 
892 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  30.79 
 
 
785 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  27.96 
 
 
782 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  28.71 
 
 
868 aa  127  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  28.71 
 
 
868 aa  127  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  28.8 
 
 
868 aa  127  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.91 
 
 
867 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  28.39 
 
 
869 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.82 
 
 
835 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  29.9 
 
 
868 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  29.9 
 
 
874 aa  125  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  28.16 
 
 
868 aa  124  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  30.61 
 
 
906 aa  124  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  26.49 
 
 
758 aa  124  7e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.54 
 
 
869 aa  124  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  29.07 
 
 
868 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  29.21 
 
 
868 aa  122  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  29.04 
 
 
866 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  30.23 
 
 
809 aa  120  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  28.25 
 
 
812 aa  120  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  28.76 
 
 
870 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.49 
 
 
810 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  28.34 
 
 
891 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  26.63 
 
 
758 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  27.51 
 
 
890 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.04 
 
 
884 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  26.33 
 
 
758 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  28.94 
 
 
868 aa  118  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  28.09 
 
 
810 aa  117  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  30.65 
 
 
865 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  27.52 
 
 
809 aa  117  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.05 
 
 
903 aa  117  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.66 
 
 
889 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  29.14 
 
 
886 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  28.51 
 
 
869 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  28.48 
 
 
382 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  30.1 
 
 
765 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.63 
 
 
852 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  31.88 
 
 
885 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  28.8 
 
 
366 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  31.8 
 
 
923 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  31.92 
 
 
414 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  31.54 
 
 
885 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  26.81 
 
 
793 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  26.14 
 
 
779 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  28.99 
 
 
760 aa  111  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  26.06 
 
 
824 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  29.48 
 
 
819 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  33.66 
 
 
826 aa  106  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  28.09 
 
 
868 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.15 
 
 
821 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.33 
 
 
868 aa  105  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  30.18 
 
 
812 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  31.1 
 
 
1115 aa  104  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  50 
 
 
359 aa  104  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  29.01 
 
 
364 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  28.49 
 
 
792 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  28.49 
 
 
792 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  28.78 
 
 
792 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05843  phosphoenolpyruvate synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14790)  28.81 
 
 
911 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775081  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0540  PEP-utilising protein mobile region  48.28 
 
 
558 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  29.33 
 
 
842 aa  103  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  28.49 
 
 
792 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  28.49 
 
 
792 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  29.14 
 
 
810 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  28.78 
 
 
792 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>