More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3011 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
726 aa  1459    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  38.65 
 
 
725 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2917  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  38.96 
 
 
692 aa  426  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  37.66 
 
 
810 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  36.25 
 
 
809 aa  179  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  35.71 
 
 
812 aa  178  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.44 
 
 
887 aa  176  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  31.09 
 
 
757 aa  171  6e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  33.66 
 
 
781 aa  169  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.67 
 
 
840 aa  168  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  35.05 
 
 
760 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  35.06 
 
 
809 aa  164  7e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  31.23 
 
 
782 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  33.77 
 
 
779 aa  160  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  30.75 
 
 
825 aa  160  8e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  34.08 
 
 
334 aa  160  9e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  32.35 
 
 
754 aa  159  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  32.46 
 
 
799 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.75 
 
 
891 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  30.11 
 
 
891 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  31.78 
 
 
764 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  29.82 
 
 
871 aa  157  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  28.3 
 
 
758 aa  157  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  33.01 
 
 
824 aa  157  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  31.23 
 
 
758 aa  156  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  30.6 
 
 
758 aa  156  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  31.46 
 
 
761 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  30.29 
 
 
758 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  32.04 
 
 
788 aa  154  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  30.91 
 
 
758 aa  154  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 
780 aa  154  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  30.36 
 
 
762 aa  153  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  29.97 
 
 
758 aa  153  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  32.23 
 
 
761 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.23 
 
 
869 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  30.62 
 
 
758 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  32.28 
 
 
785 aa  151  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  31.23 
 
 
762 aa  150  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  33.93 
 
 
865 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  33.13 
 
 
366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  31.23 
 
 
769 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  36.3 
 
 
971 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.85 
 
 
302 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.35 
 
 
887 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  35.1 
 
 
907 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  37.54 
 
 
835 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.39 
 
 
852 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  34.19 
 
 
364 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 
868 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  31.61 
 
 
892 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 
868 aa  144  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 
868 aa  144  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  31.94 
 
 
359 aa  144  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  29.94 
 
 
866 aa  144  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  28.95 
 
 
868 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.82 
 
 
902 aa  143  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  29.08 
 
 
868 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  32.5 
 
 
885 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  27.81 
 
 
868 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  32.32 
 
 
785 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.72 
 
 
889 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  28.24 
 
 
890 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  30.91 
 
 
786 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  33.11 
 
 
885 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.27 
 
 
950 aa  139  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.72 
 
 
884 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  28.53 
 
 
869 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  31.68 
 
 
796 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  31.06 
 
 
791 aa  138  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  31.03 
 
 
795 aa  138  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  29.29 
 
 
868 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  34.08 
 
 
875 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 
868 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  29.91 
 
 
791 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  37.18 
 
 
414 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  31.56 
 
 
805 aa  135  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  29.08 
 
 
760 aa  135  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  31.34 
 
 
793 aa  135  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  31.42 
 
 
906 aa  135  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  32.81 
 
 
790 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  32.67 
 
 
815 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  30.43 
 
 
789 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  31.15 
 
 
792 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  31.15 
 
 
792 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  32.21 
 
 
812 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  28.16 
 
 
382 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  29.69 
 
 
789 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  32.74 
 
 
801 aa  134  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  29.69 
 
 
789 aa  133  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  29.81 
 
 
789 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  29.69 
 
 
789 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  29.69 
 
 
789 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  30.84 
 
 
792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 
789 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 
789 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  33.64 
 
 
795 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  29.81 
 
 
808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  29.61 
 
 
874 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  30.84 
 
 
792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  33.43 
 
 
787 aa  132  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>