More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2432 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 359 aa  683    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  47.71 
 
 		 414 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  50.66 
 
 		 386 aa  289  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  49.36 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  53.37 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0076  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  49.14 
 
 		 408 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  46.99 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  37.88 
 
 		 799 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 785 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  34.35 
 
 		 760 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  32.37 
 
 		 780 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  31.86 
 
 		 785 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  31.46 
 
 		 769 aa  171  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  32.72 
 
 		 758 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  31.93 
 
 		 788 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  33.59 
 
 		 809 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  35.6 
 
 		 762 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  33.64 
 
 		 758 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  32.72 
 
 		 758 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  29.82 
 
 		 757 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  35.44 
 
 		 824 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.02 
 
 		 810 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  30.7 
 
 		 758 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  33.8 
 
 		 801 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  30.23 
 
 		 758 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  29.04 
 
 		 758 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  30.88 
 
 		 754 aa  159  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  34.43 
 
 		 797 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  35.19 
 
 		 794 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  34.97 
 
 		 799 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  34.97 
 
 		 799 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  34.97 
 
 		 799 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  34.97 
 
 		 799 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  34.97 
 
 		 812 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  34.97 
 
 		 799 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  34.15 
 
 		 800 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  30.47 
 
 		 758 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  34.97 
 
 		 799 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  31.14 
 
 		 761 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  34.28 
 
 		 801 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  34.97 
 
 		 799 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  34.65 
 
 		 787 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  35.19 
 
 		 795 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0618  phosphoenolpyruvate synthase  36.13 
 
 		 779 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.285681  normal  0.283307 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  35.49 
 
 		 810 aa  153  4e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  33.14 
 
 		 791 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  34.41 
 
 		 794 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  30.35 
 
 		 781 aa  152  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  32.79 
 
 		 788 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 799 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  34.39 
 
 		 799 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 799 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  35.61 
 
 		 812 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  28.94 
 
 		 779 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  33.95 
 
 		 761 aa  151  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  31.82 
 
 		 799 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  35.36 
 
 		 798 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  33.99 
 
 		 801 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  32.86 
 
 		 799 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 800 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 800 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  33.78 
 
 		 815 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 800 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 792 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  35.29 
 
 		 795 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  31.67 
 
 		 765 aa  149  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  35 
 
 		 795 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  34.34 
 
 		 809 aa  149  7e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  33.16 
 
 		 784 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 		 789 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 		 789 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 		 789 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  33.61 
 
 		 789 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  33.43 
 
 		 799 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  33.61 
 
 		 792 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  33.07 
 
 		 792 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  33.61 
 
 		 792 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  33.07 
 
 		 792 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  34.31 
 
 		 801 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  34.36 
 
 		 762 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  33.07 
 
 		 792 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  34.31 
 
 		 800 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  33.07 
 
 		 792 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  33.07 
 
 		 792 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  34.17 
 
 		 789 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  32.31 
 
 		 792 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  34.01 
 
 		 795 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  33.53 
 
 		 790 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 791 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 		 789 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  31.36 
 
 		 764 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  33.89 
 
 		 789 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  32.46 
 
 		 839 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  33.71 
 
 		 796 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  32.46 
 
 		 839 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 796 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  32.56 
 
 		 790 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  32.53 
 
 		 796 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  30.95 
 
 		 789 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  32.23 
 
 		 782 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>