More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0076 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0076  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 408 aa  764    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  65.11 
 
 		 414 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  54.28 
 
 		 386 aa  362  7.0000000000000005e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  57.59 
 
 		 389 aa  323  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  52.99 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  49.63 
 
 		 359 aa  274  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  40.28 
 
 		 760 aa  238  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  36.67 
 
 		 754 aa  229  5e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  31.86 
 
 		 758 aa  229  8e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  35.92 
 
 		 785 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  36.42 
 
 		 799 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  31.16 
 
 		 758 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  36.77 
 
 		 780 aa  223  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  32.56 
 
 		 758 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.38 
 
 		 810 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  35.33 
 
 		 785 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  32.03 
 
 		 757 aa  219  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  37.35 
 
 		 762 aa  219  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  36.47 
 
 		 761 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  34.03 
 
 		 758 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  37.79 
 
 		 809 aa  216  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  34.51 
 
 		 788 aa  216  7e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  34.68 
 
 		 824 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  32.43 
 
 		 769 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  36.07 
 
 		 781 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  38.62 
 
 		 810 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  33.8 
 
 		 758 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 758 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  35.43 
 
 		 761 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  36.16 
 
 		 812 aa  210  3e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 758 aa  210  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  36.03 
 
 		 809 aa  207  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  32.96 
 
 		 789 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 779 aa  202  9e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  33.03 
 
 		 789 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  33.03 
 
 		 789 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  33.03 
 
 		 789 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  33.03 
 
 		 789 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 789 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  33.03 
 
 		 789 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  33.88 
 
 		 762 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  30.66 
 
 		 764 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  36.36 
 
 		 765 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  32.58 
 
 		 789 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  32.58 
 
 		 789 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  34.47 
 
 		 792 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  34.47 
 
 		 792 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  34.47 
 
 		 792 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 		 786 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 791 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  34.24 
 
 		 792 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 799 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  34 
 
 		 794 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  34.24 
 
 		 792 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 812 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  34.15 
 
 		 800 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  34.15 
 
 		 800 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  34.15 
 
 		 800 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 799 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 799 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 808 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 799 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 792 aa  194  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 799 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 799 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 799 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  35.54 
 
 		 789 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  33.18 
 
 		 792 aa  193  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  32.28 
 
 		 789 aa  193  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 799 aa  193  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  32.35 
 
 		 789 aa  192  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 800 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  33.92 
 
 		 799 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  33.92 
 
 		 799 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 792 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  34.4 
 
 		 787 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 792 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 801 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 792 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 792 aa  190  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 792 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  33.63 
 
 		 790 aa  190  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 792 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 792 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  32.88 
 
 		 792 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  32.66 
 
 		 790 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 795 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 795 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  33.63 
 
 		 795 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 803 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  31.85 
 
 		 801 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  34.63 
 
 		 790 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  33.11 
 
 		 792 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  35.67 
 
 		 800 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  31.83 
 
 		 789 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  33.1 
 
 		 782 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  33.79 
 
 		 792 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  31.44 
 
 		 795 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  33.11 
 
 		 801 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  32.05 
 
 		 790 aa  186  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>