More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0459 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  100 
 
 		 389 aa  718    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  56.09 
 
 		 414 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0076  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  58.48 
 
 		 408 aa  342  8e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  55.5 
 
 		 386 aa  336  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  50.51 
 
 		 386 aa  328  8e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  54.52 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  40.57 
 
 		 760 aa  227  3e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  34.17 
 
 		 769 aa  222  9e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  36.26 
 
 		 785 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  43.16 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  41.03 
 
 		 799 aa  215  9e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  40.18 
 
 		 754 aa  211  1e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 		 758 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  36.18 
 
 		 785 aa  210  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  35.75 
 
 		 758 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.49 
 
 		 810 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 765 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  36.32 
 
 		 788 aa  206  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  38.68 
 
 		 761 aa  206  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  36.23 
 
 		 758 aa  206  7e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  35.57 
 
 		 757 aa  202  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  35.9 
 
 		 780 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  37.61 
 
 		 761 aa  200  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  35.81 
 
 		 758 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  36.39 
 
 		 762 aa  199  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  37.91 
 
 		 801 aa  199  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  36.23 
 
 		 758 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  35.09 
 
 		 824 aa  197  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  35.65 
 
 		 758 aa  195  9e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  39.6 
 
 		 762 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 		 799 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 		 799 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  36.73 
 
 		 792 aa  194  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  35.56 
 
 		 799 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  32.03 
 
 		 758 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  37.43 
 
 		 800 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  37.43 
 
 		 800 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  37.43 
 
 		 800 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  37.43 
 
 		 812 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  37.57 
 
 		 798 aa  193  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  37.43 
 
 		 799 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  37.43 
 
 		 799 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  37.43 
 
 		 799 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  37.43 
 
 		 799 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  37.43 
 
 		 799 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  37.43 
 
 		 799 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  36.81 
 
 		 792 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  36.08 
 
 		 792 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  36.08 
 
 		 792 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  36.08 
 
 		 792 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  36.08 
 
 		 792 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  37.16 
 
 		 799 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 		 792 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  36.08 
 
 		 792 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  36.89 
 
 		 799 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  35.82 
 
 		 792 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  37.37 
 
 		 794 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 		 795 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  35.82 
 
 		 792 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  35.82 
 
 		 792 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  36.01 
 
 		 792 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  36.96 
 
 		 800 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  36.86 
 
 		 812 aa  188  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  36.46 
 
 		 801 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  36.01 
 
 		 792 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  36.01 
 
 		 792 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  36.01 
 
 		 792 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  36.83 
 
 		 792 aa  187  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  37.5 
 
 		 795 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  37.6 
 
 		 796 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  37.6 
 
 		 801 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  36.8 
 
 		 794 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  36.01 
 
 		 792 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  37.2 
 
 		 799 aa  186  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  37.57 
 
 		 800 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  36.44 
 
 		 796 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  34.54 
 
 		 782 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  35.55 
 
 		 794 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  35.55 
 
 		 794 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  42.57 
 
 		 804 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  35.55 
 
 		 794 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  37.29 
 
 		 801 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  31.98 
 
 		 781 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  37.3 
 
 		 795 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  38.89 
 
 		 809 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  32.13 
 
 		 764 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  41.86 
 
 		 814 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  35.38 
 
 		 792 aa  182  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  36.12 
 
 		 799 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  36.32 
 
 		 792 aa  182  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  35.38 
 
 		 791 aa  182  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  34.21 
 
 		 795 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  34.47 
 
 		 795 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  39.53 
 
 		 812 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  37.11 
 
 		 790 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  36.9 
 
 		 797 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  38.55 
 
 		 786 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 		 810 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  37 
 
 		 790 aa  180  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  37.17 
 
 		 809 aa  180  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>