More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2434 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  100 
 
 		 434 aa  840    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  47.12 
 
 		 359 aa  256  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  32.87 
 
 		 799 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.53 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  32.02 
 
 		 785 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  42.59 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  37.61 
 
 		 414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  32.1 
 
 		 785 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  30.91 
 
 		 780 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 760 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  32.18 
 
 		 788 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  36.16 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  31.76 
 
 		 762 aa  176  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  33.97 
 
 		 754 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  29.44 
 
 		 758 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0076  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.05 
 
 		 408 aa  170  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  28.02 
 
 		 758 aa  169  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  31.31 
 
 		 764 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.58 
 
 		 810 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  30.18 
 
 		 794 aa  166  9e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 		 781 aa  166  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  27.81 
 
 		 758 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  27.61 
 
 		 758 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  33.06 
 
 		 761 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  32.79 
 
 		 761 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  33.16 
 
 		 762 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  33.42 
 
 		 824 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  30.25 
 
 		 769 aa  156  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  33.78 
 
 		 810 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  33.51 
 
 		 809 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  30.89 
 
 		 782 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  29.35 
 
 		 758 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  30.33 
 
 		 757 aa  152  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  29.89 
 
 		 758 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  31.09 
 
 		 779 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  33.24 
 
 		 809 aa  151  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  32.89 
 
 		 812 aa  149  7e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  30.17 
 
 		 765 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  31.92 
 
 		 794 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  30.25 
 
 		 758 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  32.72 
 
 		 796 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  32.72 
 
 		 796 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  31.42 
 
 		 795 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  30.57 
 
 		 796 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  31.15 
 
 		 799 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  31.69 
 
 		 798 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  31.22 
 
 		 801 aa  137  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  31.84 
 
 		 795 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  31.42 
 
 		 794 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  30.86 
 
 		 799 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  31.67 
 
 		 795 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  30 
 
 		 798 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  31.43 
 
 		 797 aa  133  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  30.69 
 
 		 791 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  29.63 
 
 		 795 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  30.85 
 
 		 799 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  30.85 
 
 		 799 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  29.86 
 
 		 800 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  29.86 
 
 		 800 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  29.86 
 
 		 800 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  30.3 
 
 		 796 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  32.1 
 
 		 787 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  30.35 
 
 		 800 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  30.6 
 
 		 799 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  29.08 
 
 		 792 aa  130  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  29.93 
 
 		 801 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  29.37 
 
 		 795 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  30.96 
 
 		 792 aa  129  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  31.5 
 
 		 792 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  33.43 
 
 		 871 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  31.51 
 
 		 799 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  28.81 
 
 		 792 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  28.81 
 
 		 792 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  29.28 
 
 		 792 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  28.81 
 
 		 792 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  28.81 
 
 		 792 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  30.69 
 
 		 791 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  31.51 
 
 		 799 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  31.51 
 
 		 812 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  31.51 
 
 		 799 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  31.35 
 
 		 801 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  28.81 
 
 		 792 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  31.51 
 
 		 799 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  29.28 
 
 		 789 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  28.81 
 
 		 792 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  31.51 
 
 		 799 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  30.12 
 
 		 799 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  29.28 
 
 		 789 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  28.86 
 
 		 794 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  29.28 
 
 		 789 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  31.51 
 
 		 799 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  29.28 
 
 		 792 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  31.23 
 
 		 791 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  29.35 
 
 		 789 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  31.51 
 
 		 799 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  28.81 
 
 		 792 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  28.86 
 
 		 794 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  30.02 
 
 		 784 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  30.42 
 
 		 791 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  30.62 
 
 		 810 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>