More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4547 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 386 aa  753    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  51.09 
 
 		 414 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  50 
 
 		 386 aa  323  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  55.87 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0076  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  52.86 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  50.92 
 
 		 359 aa  294  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  39 
 
 		 754 aa  261  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  38.03 
 
 		 824 aa  260  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  36.99 
 
 		 769 aa  258  8e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  35.99 
 
 		 785 aa  245  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  37.82 
 
 		 762 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  37.82 
 
 		 761 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  36.34 
 
 		 758 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  35.93 
 
 		 785 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  38.02 
 
 		 762 aa  240  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  38.14 
 
 		 761 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  35.81 
 
 		 758 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  35.92 
 
 		 799 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  36.34 
 
 		 788 aa  237  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  35.63 
 
 		 758 aa  236  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  35.39 
 
 		 758 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  35.17 
 
 		 781 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  36.6 
 
 		 780 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  38.73 
 
 		 765 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.96 
 
 		 810 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  36.22 
 
 		 782 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  34.65 
 
 		 757 aa  230  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  37.27 
 
 		 760 aa  230  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  37.12 
 
 		 779 aa  230  4e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  33.49 
 
 		 758 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  34.41 
 
 		 758 aa  222  7e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  34.89 
 
 		 794 aa  222  9e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 758 aa  222  9e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  37.36 
 
 		 809 aa  219  5e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 764 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  35.2 
 
 		 812 aa  216  5e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  34.73 
 
 		 801 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  41.81 
 
 		 810 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  40.47 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  41.52 
 
 		 809 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  36.45 
 
 		 789 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  38.78 
 
 		 794 aa  209  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  36.15 
 
 		 792 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  36.01 
 
 		 799 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  35.07 
 
 		 799 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  39.12 
 
 		 799 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  35.07 
 
 		 799 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  35 
 
 		 800 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  35.07 
 
 		 799 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  35.23 
 
 		 799 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  35.07 
 
 		 799 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  39.12 
 
 		 799 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  35.07 
 
 		 799 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  35.07 
 
 		 812 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  35.07 
 
 		 799 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  34.84 
 
 		 799 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  39.12 
 
 		 800 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  39.12 
 
 		 800 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  39.12 
 
 		 800 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  33.71 
 
 		 799 aa  204  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  35.89 
 
 		 791 aa  203  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  36.98 
 
 		 799 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1699  phosphoenolpyruvate synthase  39.12 
 
 		 800 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.251717  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  35.68 
 
 		 787 aa  203  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  34.72 
 
 		 790 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  34.09 
 
 		 792 aa  202  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  35.16 
 
 		 792 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  38.61 
 
 		 794 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  43.56 
 
 		 873 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 792 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  38.82 
 
 		 801 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  33.86 
 
 		 792 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2438  phosphoenolpyruvate synthase  38.94 
 
 		 801 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972203  normal  0.0321023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 798 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  38.36 
 
 		 792 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  34.34 
 
 		 760 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  38.69 
 
 		 801 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  37.85 
 
 		 791 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 792 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  38.19 
 
 		 795 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 792 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  37.85 
 
 		 791 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  35.2 
 
 		 792 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 792 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 792 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  33.86 
 
 		 792 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  33.19 
 
 		 792 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  33.7 
 
 		 797 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  34.13 
 
 		 791 aa  199  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  34.4 
 
 		 798 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  37.99 
 
 		 795 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  34.3 
 
 		 791 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2174  phosphoenolpyruvate synthase  35.28 
 
 		 792 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0176662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  35.15 
 
 		 815 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  34.98 
 
 		 791 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  34.53 
 
 		 790 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  34.7 
 
 		 792 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  33.91 
 
 		 803 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  35.65 
 
 		 800 aa  197  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  37.71 
 
 		 795 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>