More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1069 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  100 
 
 
835 aa  1589    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.19 
 
 
840 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  31.34 
 
 
892 aa  231  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.43 
 
 
902 aa  225  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.54 
 
 
891 aa  223  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  26.91 
 
 
871 aa  211  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  27.91 
 
 
837 aa  210  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  30.62 
 
 
871 aa  209  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4241  hypothetical protein  28.72 
 
 
560 aa  207  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  26.02 
 
 
874 aa  199  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  27.49 
 
 
870 aa  197  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  24.18 
 
 
825 aa  188  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.21 
 
 
884 aa  188  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  28.89 
 
 
842 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  28.89 
 
 
842 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.64 
 
 
975 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  37.5 
 
 
797 aa  159  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  40.07 
 
 
873 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  39.93 
 
 
971 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  43.2 
 
 
788 aa  149  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  40.36 
 
 
791 aa  148  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  42.24 
 
 
835 aa  147  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  28.16 
 
 
885 aa  145  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  41.13 
 
 
886 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  37.08 
 
 
867 aa  141  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  27.74 
 
 
725 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.63 
 
 
592 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  39.06 
 
 
907 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  41.55 
 
 
765 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  27.38 
 
 
885 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  47.22 
 
 
842 aa  135  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.35 
 
 
950 aa  135  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  32.67 
 
 
866 aa  134  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.6 
 
 
887 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  33.55 
 
 
781 aa  132  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.07 
 
 
810 aa  131  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.1 
 
 
302 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  43.69 
 
 
869 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  36.63 
 
 
275 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  38.53 
 
 
865 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  35.67 
 
 
780 aa  129  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.35 
 
 
887 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  37.84 
 
 
811 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  34.84 
 
 
868 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  34.84 
 
 
869 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.08 
 
 
903 aa  127  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  37.76 
 
 
906 aa  127  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  27.21 
 
 
708 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  38.49 
 
 
963 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  33.13 
 
 
799 aa  126  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  44.57 
 
 
854 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  34.84 
 
 
869 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  33.19 
 
 
868 aa  125  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  34.64 
 
 
785 aa  125  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  31.65 
 
 
782 aa  125  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  34.84 
 
 
868 aa  125  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  34.84 
 
 
868 aa  125  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  33.83 
 
 
364 aa  125  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.16 
 
 
386 aa  124  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  35.17 
 
 
785 aa  124  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  37.62 
 
 
760 aa  124  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  40.99 
 
 
821 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  38.49 
 
 
956 aa  124  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  30.45 
 
 
890 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  34.91 
 
 
868 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  40.93 
 
 
826 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  34.06 
 
 
359 aa  122  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  35.65 
 
 
868 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.69 
 
 
971 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  34.41 
 
 
788 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  42.8 
 
 
434 aa  121  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  31.13 
 
 
891 aa  121  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  33.97 
 
 
334 aa  121  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1604  hypothetical protein  31.29 
 
 
602 aa  121  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  34.23 
 
 
868 aa  121  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0511  hypothetical protein  28.94 
 
 
594 aa  121  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493067  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  30.75 
 
 
758 aa  120  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  34.39 
 
 
868 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1575  hypothetical protein  29.49 
 
 
610 aa  120  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270865  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  32.34 
 
 
754 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  29.5 
 
 
758 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.33 
 
 
971 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  29.97 
 
 
758 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  31.91 
 
 
762 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.13 
 
 
959 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  33.43 
 
 
366 aa  115  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  51.92 
 
 
414 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  37.03 
 
 
386 aa  115  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  32.04 
 
 
761 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  31.95 
 
 
762 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  29.9 
 
 
758 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  30.86 
 
 
824 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  29.19 
 
 
761 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  38.46 
 
 
1240 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  57 
 
 
389 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  43.1 
 
 
359 aa  111  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  28.92 
 
 
764 aa  111  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.88 
 
 
852 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.64 
 
 
889 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2100  hypothetical protein  28.67 
 
 
609 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>