More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1604 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1604  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1244    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1996  hypothetical protein  62.71 
 
 		 622 aa  791    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0906204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2100  hypothetical protein  48.68 
 
 		 609 aa  598  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1575  hypothetical protein  45.59 
 
 		 610 aa  541  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270865  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0511  hypothetical protein  45.83 
 
 		 594 aa  526  1e-148  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493067  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0515  hypothetical protein  31.99 
 
 		 546 aa  264  4e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  26.54 
 
 		 592 aa  160  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0529  hypothetical protein  30.09 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.815873  normal  0.673561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4241  hypothetical protein  24.46 
 
 		 560 aa  132  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  34.51 
 
 		 892 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  30.88 
 
 		 866 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  35.65 
 
 		 837 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.93 
 
 		 840 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  31.68 
 
 		 835 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  28.83 
 
 		 871 aa  110  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  33.66 
 
 		 874 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  46.6 
 
 		 868 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.07 
 
 		 902 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  45.63 
 
 		 868 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  46.6 
 
 		 868 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  47.52 
 
 		 868 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  46.6 
 
 		 868 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  45.63 
 
 		 869 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  45.63 
 
 		 869 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  39.71 
 
 		 868 aa  107  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4575  PEP-utilising protein mobile region  30.77 
 
 		 312 aa  107  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.27 
 
 		 891 aa  107  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  43.69 
 
 		 868 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  44.66 
 
 		 868 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  46.08 
 
 		 887 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  33.64 
 
 		 886 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  30.18 
 
 		 842 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0540  PEP-utilising protein mobile region  43.27 
 
 		 558 aa  103  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  32.88 
 
 		 865 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  33.18 
 
 		 791 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  49 
 
 		 758 aa  102  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  45.63 
 
 		 890 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  46 
 
 		 870 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  42.57 
 
 		 825 aa  100  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  47.52 
 
 		 852 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  36.54 
 
 		 811 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  43.81 
 
 		 762 aa  99  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  46.6 
 
 		 887 aa  98.6  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  43.4 
 
 		 785 aa  97.4  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  42 
 
 		 780 aa  97.1  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.63 
 
 		 903 aa  97.1  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  45.92 
 
 		 765 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  42 
 
 		 788 aa  96.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30 
 
 		 971 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  45.63 
 
 		 891 aa  96.3  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  47 
 
 		 758 aa  96.3  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30 
 
 		 971 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45 
 
 		 386 aa  95.9  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.02 
 
 		 889 aa  96.3  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  44 
 
 		 799 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  31.65 
 
 		 871 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  31.02 
 
 		 788 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  31.82 
 
 		 907 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4026  PEP-utilising enzyme, mobile region  44.76 
 
 		 537 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.756461  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.81 
 
 		 810 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  50.6 
 
 		 835 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  47.52 
 
 		 869 aa  95.1  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  46 
 
 		 779 aa  95.1  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  42.86 
 
 		 762 aa  94.7  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  37.93 
 
 		 434 aa  94.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  41.35 
 
 		 758 aa  94.4  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  41.96 
 
 		 760 aa  94.4  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  46 
 
 		 758 aa  94.4  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  41.96 
 
 		 414 aa  94  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  45.63 
 
 		 906 aa  94  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.85 
 
 		 975 aa  94  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  47.17 
 
 		 809 aa  93.6  9e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  39 
 
 		 764 aa  93.2  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  45.05 
 
 		 812 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  38.89 
 
 		 785 aa  93.2  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  41.74 
 
 		 761 aa  93.6  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  40.52 
 
 		 754 aa  92.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  44 
 
 		 761 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  46.23 
 
 		 809 aa  92.8  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  43.1 
 
 		 790 aa  92.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.33 
 
 		 884 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32 
 
 		 959 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  44.33 
 
 		 760 aa  91.7  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  41.8 
 
 		 810 aa  90.9  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  42 
 
 		 758 aa  90.5  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  40.91 
 
 		 799 aa  89.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  41.03 
 
 		 825 aa  89.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 769 aa  89.7  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  42.42 
 
 		 793 aa  89.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  40.57 
 
 		 359 aa  89.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  44.12 
 
 		 963 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  30.95 
 
 		 956 aa  89.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  42.06 
 
 		 821 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  41.59 
 
 		 800 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.09 
 
 		 950 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  39.39 
 
 		 793 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  45.19 
 
 		 873 aa  88.6  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  40.78 
 
 		 386 aa  88.6  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  44.33 
 
 		 789 aa  88.6  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  41.41 
 
 		 797 aa  88.6  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>