More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0511 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0511  hypothetical protein  100 
 
 
594 aa  1213    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493067  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2100  hypothetical protein  46.1 
 
 
609 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1575  hypothetical protein  45.9 
 
 
610 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1604  hypothetical protein  45.83 
 
 
602 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1996  hypothetical protein  44.71 
 
 
622 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0906204  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0515  hypothetical protein  41.59 
 
 
546 aa  392  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0529  hypothetical protein  36.39 
 
 
360 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.815873  normal  0.673561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4241  hypothetical protein  32.1 
 
 
560 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  37.91 
 
 
869 aa  133  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  37.91 
 
 
868 aa  133  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  35.21 
 
 
868 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  37.68 
 
 
868 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  37.91 
 
 
868 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  38.57 
 
 
868 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  39.61 
 
 
868 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  39.61 
 
 
868 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  33.94 
 
 
866 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  38.16 
 
 
868 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  36.49 
 
 
869 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  34.86 
 
 
871 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  31.18 
 
 
870 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.5 
 
 
891 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  29.92 
 
 
592 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  38.1 
 
 
890 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  30.89 
 
 
865 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  35.68 
 
 
874 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  29.4 
 
 
892 aa  120  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  32.47 
 
 
837 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.43 
 
 
903 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.03 
 
 
887 aa  118  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  35.07 
 
 
889 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.75 
 
 
887 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  36.23 
 
 
842 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.07 
 
 
840 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  50.5 
 
 
764 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  51.4 
 
 
852 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  50 
 
 
785 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  44.83 
 
 
434 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  32.2 
 
 
891 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.88 
 
 
959 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.07 
 
 
902 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  49.07 
 
 
799 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  48.7 
 
 
762 aa  108  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  48.11 
 
 
769 aa  108  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  52.94 
 
 
809 aa  107  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  43.52 
 
 
758 aa  107  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  23.81 
 
 
884 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  49.51 
 
 
825 aa  107  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  45.54 
 
 
788 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  51.85 
 
 
812 aa  106  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  50.45 
 
 
761 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.29 
 
 
975 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  44.34 
 
 
785 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  44.19 
 
 
762 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  30.83 
 
 
835 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  41.54 
 
 
754 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  46.53 
 
 
780 aa  105  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4575  PEP-utilising protein mobile region  32.69 
 
 
312 aa  104  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  36.36 
 
 
811 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  50.46 
 
 
809 aa  104  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  48.54 
 
 
386 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4026  PEP-utilising enzyme, mobile region  31.23 
 
 
537 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.756461  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  47.66 
 
 
869 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  30.99 
 
 
871 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  46.15 
 
 
758 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  44.66 
 
 
1097 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.44 
 
 
971 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  45.19 
 
 
757 aa  101  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  42.37 
 
 
779 aa  101  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.44 
 
 
971 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  45.19 
 
 
760 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  45.54 
 
 
782 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  43.56 
 
 
781 aa  100  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  43.27 
 
 
963 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  28.77 
 
 
956 aa  100  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  50.6 
 
 
835 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0540  PEP-utilising protein mobile region  40.37 
 
 
558 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  45.53 
 
 
810 aa  99  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  32.21 
 
 
842 aa  98.6  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  32.21 
 
 
842 aa  98.6  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  45.63 
 
 
386 aa  98.2  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  45.45 
 
 
761 aa  98.2  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  45.19 
 
 
758 aa  98.2  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  44.95 
 
 
824 aa  98.2  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  39.25 
 
 
794 aa  96.3  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  32.34 
 
 
708 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  41.59 
 
 
792 aa  96.3  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  44.76 
 
 
791 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  44.55 
 
 
758 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  32.34 
 
 
725 aa  95.9  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.43 
 
 
867 aa  95.5  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.07 
 
 
950 aa  95.5  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0076  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43.81 
 
 
408 aa  94.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  47.06 
 
 
810 aa  94.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  46.08 
 
 
359 aa  94.7  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  43.69 
 
 
788 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  43.43 
 
 
778 aa  94.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  46.46 
 
 
790 aa  94  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  42.57 
 
 
765 aa  94  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  38.24 
 
 
793 aa  94  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>