More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4026 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4026  PEP-utilising enzyme, mobile region  100 
 
 
537 aa  1063    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.756461  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  31.2 
 
 
791 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  31.86 
 
 
890 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4241  hypothetical protein  33.33 
 
 
560 aa  134  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  28.33 
 
 
788 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.86 
 
 
873 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  26.28 
 
 
868 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
874 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  31.63 
 
 
891 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  27.91 
 
 
868 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  27.57 
 
 
868 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  27.57 
 
 
868 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  26.92 
 
 
868 aa  123  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  28.28 
 
 
869 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  27.36 
 
 
868 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  26.3 
 
 
868 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.52 
 
 
887 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  28 
 
 
869 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  27.95 
 
 
868 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  35.67 
 
 
907 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.86 
 
 
592 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.97 
 
 
887 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  31.51 
 
 
842 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  31.51 
 
 
842 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.72 
 
 
903 aa  114  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  28.95 
 
 
871 aa  114  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  27.15 
 
 
870 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.19 
 
 
891 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.77 
 
 
821 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  35 
 
 
867 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.08 
 
 
950 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  25.35 
 
 
854 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.46 
 
 
884 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  33.9 
 
 
826 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  30.41 
 
 
837 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.23 
 
 
852 aa  110  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  28.74 
 
 
865 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  29.45 
 
 
708 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  29.45 
 
 
725 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  34.64 
 
 
854 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  36.93 
 
 
886 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  29.22 
 
 
842 aa  107  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  38.86 
 
 
811 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0511  hypothetical protein  31.23 
 
 
594 aa  103  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493067  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  31.09 
 
 
885 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  27.24 
 
 
866 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  52.38 
 
 
809 aa  101  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1575  hypothetical protein  30.69 
 
 
610 aa  101  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  30.23 
 
 
906 aa  100  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  30.77 
 
 
885 aa  100  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.93 
 
 
959 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.87 
 
 
889 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  32.38 
 
 
892 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  32.86 
 
 
871 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  49.11 
 
 
812 aa  97.4  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  28.28 
 
 
963 aa  96.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.44 
 
 
902 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  50.5 
 
 
809 aa  95.5  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1604  hypothetical protein  44.76 
 
 
602 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.75 
 
 
869 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.67 
 
 
840 aa  94.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  45.9 
 
 
971 aa  94  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  49 
 
 
765 aa  94  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.6 
 
 
971 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.6 
 
 
971 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  48.25 
 
 
810 aa  92.4  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4575  PEP-utilising protein mobile region  35.62 
 
 
312 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2100  hypothetical protein  43.69 
 
 
609 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1996  hypothetical protein  45.63 
 
 
622 aa  92  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0906204  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  43 
 
 
779 aa  90.1  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  40.87 
 
 
794 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  43 
 
 
758 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  43 
 
 
825 aa  88.6  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  44.54 
 
 
754 aa  88.2  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.27 
 
 
975 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  40.83 
 
 
414 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  30.6 
 
 
956 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0540  PEP-utilising protein mobile region  36.88 
 
 
558 aa  85.1  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  44.95 
 
 
810 aa  85.1  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  46 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  45.87 
 
 
793 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  45 
 
 
788 aa  84.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  45.1 
 
 
760 aa  84.7  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  41 
 
 
758 aa  84.3  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  42 
 
 
758 aa  84  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.24 
 
 
868 aa  83.2  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.44 
 
 
835 aa  83.2  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  41.28 
 
 
803 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  33.16 
 
 
725 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  41.41 
 
 
819 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0515  hypothetical protein  31.47 
 
 
546 aa  81.6  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  40.78 
 
 
825 aa  81.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 
837 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  46.94 
 
 
810 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  36 
 
 
769 aa  80.1  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  39.68 
 
 
762 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  42.27 
 
 
804 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  43.43 
 
 
809 aa  79  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  31.6 
 
 
835 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  42 
 
 
761 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>