More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0515 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0515  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1108    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0511  hypothetical protein  41.59 
 
 		 594 aa  411  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493067  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0529  hypothetical protein  58.02 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.815873  normal  0.673561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1575  hypothetical protein  34.31 
 
 		 610 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2100  hypothetical protein  31.7 
 
 		 609 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1604  hypothetical protein  31.99 
 
 		 602 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1996  hypothetical protein  29.58 
 
 		 622 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0906204  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.49 
 
 		 891 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.86 
 
 		 840 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  37.89 
 
 		 889 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.65 
 
 		 868 aa  106  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  46.15 
 
 		 825 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  50.5 
 
 		 781 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  34.16 
 
 		 871 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  50 
 
 		 810 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  33.47 
 
 		 837 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  31.67 
 
 		 892 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  34.78 
 
 		 854 aa  100  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  41.48 
 
 		 760 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  51.43 
 
 		 809 aa  99.8  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  48.51 
 
 		 762 aa  99  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  33.02 
 
 		 842 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  33.02 
 
 		 842 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.53 
 
 		 902 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  48.51 
 
 		 754 aa  97.8  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  42 
 
 		 799 aa  97.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  42 
 
 		 799 aa  97.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  51.38 
 
 		 810 aa  96.7  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  50.48 
 
 		 809 aa  96.7  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  43.81 
 
 		 769 aa  96.3  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  39.29 
 
 		 782 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  36.3 
 
 		 758 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  46.53 
 
 		 785 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  43.56 
 
 		 780 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  40.91 
 
 		 785 aa  95.5  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  41.9 
 
 		 758 aa  95.9  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  50 
 
 		 812 aa  95.9  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  42.99 
 
 		 764 aa  95.1  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  44.55 
 
 		 762 aa  94.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  37.27 
 
 		 799 aa  94.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  31.5 
 
 		 708 aa  94.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  44.95 
 
 		 803 aa  94.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  46.15 
 
 		 779 aa  94.4  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  31.5 
 
 		 725 aa  94  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  38.52 
 
 		 757 aa  94  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  45.54 
 
 		 758 aa  93.6  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  46.08 
 
 		 788 aa  93.2  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.82 
 
 		 884 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  30.8 
 
 		 866 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  44.9 
 
 		 761 aa  92.8  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  36.3 
 
 		 758 aa  92.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0540  PEP-utilising protein mobile region  47.52 
 
 		 558 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1972  PEP-utilising protein mobile region  41.18 
 
 		 770 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  43.93 
 
 		 814 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  38 
 
 		 793 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4241  hypothetical protein  28.52 
 
 		 560 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  44.44 
 
 		 761 aa  91.3  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  44.55 
 
 		 758 aa  91.3  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.41 
 
 		 887 aa  90.9  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  48.57 
 
 		 386 aa  90.9  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0910  phosphoenolpyruvate synthase  40.54 
 
 		 831 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  29.24 
 
 		 869 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  28.26 
 
 		 835 aa  90.5  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  41.12 
 
 		 794 aa  89  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  28.57 
 
 		 868 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  30.08 
 
 		 869 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  33.16 
 
 		 890 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  42.57 
 
 		 758 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  41 
 
 		 799 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 868 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  28.15 
 
 		 868 aa  87.4  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  44.9 
 
 		 765 aa  87  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  45.63 
 
 		 869 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  37.38 
 
 		 760 aa  86.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  37.27 
 
 		 812 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0076  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.87 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.86 
 
 		 971 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  40 
 
 		 587 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  31.88 
 
 		 885 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.86 
 
 		 971 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  27.82 
 
 		 868 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  27.82 
 
 		 868 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  35.56 
 
 		 758 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  27.97 
 
 		 868 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  29.46 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  31.09 
 
 		 886 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  28.39 
 
 		 868 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  28.99 
 
 		 868 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  41.18 
 
 		 963 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  41.03 
 
 		 825 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  40.2 
 
 		 824 aa  84.7  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  25.77 
 
 		 842 aa  84.7  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  31.28 
 
 		 874 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.336193 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05843  phosphoenolpyruvate synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14790)  41.12 
 
 		 911 aa  83.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  33.49 
 
 		 811 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  31.16 
 
 		 885 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  44.55 
 
 		 796 aa  83.2  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  30.05 
 
 		 956 aa  83.2  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  42.06 
 
 		 795 aa  82.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 778 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>