More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4575 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4575  PEP-utilising protein mobile region  100 
 
 
312 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  51.05 
 
 
871 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  40.24 
 
 
892 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  27.54 
 
 
868 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  27.54 
 
 
868 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  28.63 
 
 
868 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  37.6 
 
 
907 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  27.21 
 
 
869 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  36.61 
 
 
865 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  26.89 
 
 
868 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  26.95 
 
 
868 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  26.56 
 
 
868 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.8 
 
 
902 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.39 
 
 
887 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  26.23 
 
 
869 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  32.29 
 
 
890 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  26.56 
 
 
868 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  29.46 
 
 
874 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  26.56 
 
 
868 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  29.92 
 
 
866 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  32.89 
 
 
891 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1575  hypothetical protein  36.32 
 
 
610 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.46 
 
 
884 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  30.53 
 
 
837 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.49 
 
 
840 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  30.08 
 
 
871 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1604  hypothetical protein  33.33 
 
 
602 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.05 
 
 
873 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  32.33 
 
 
842 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.44 
 
 
887 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2100  hypothetical protein  33.95 
 
 
609 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  28.81 
 
 
870 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.41 
 
 
889 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0511  hypothetical protein  32.69 
 
 
594 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493067  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  38.46 
 
 
867 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1996  hypothetical protein  33.49 
 
 
622 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0906204  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4026  PEP-utilising enzyme, mobile region  35.62 
 
 
537 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.756461  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.7 
 
 
891 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.44 
 
 
971 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  33.9 
 
 
842 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  33.9 
 
 
842 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.44 
 
 
971 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.58 
 
 
950 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  34.26 
 
 
835 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.72 
 
 
835 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  42.57 
 
 
779 aa  99  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4241  hypothetical protein  31.6 
 
 
560 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  33.5 
 
 
592 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.65 
 
 
959 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  33.33 
 
 
826 aa  95.9  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  33.91 
 
 
886 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  46 
 
 
825 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  38.8 
 
 
821 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  48.65 
 
 
359 aa  93.2  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.86 
 
 
975 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  31.02 
 
 
956 aa  92.8  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  33.48 
 
 
906 aa  92.4  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  40.71 
 
 
794 aa  90.9  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  45.1 
 
 
811 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  31.43 
 
 
854 aa  90.5  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  35.5 
 
 
788 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  47.96 
 
 
852 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  31.8 
 
 
903 aa  89  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  36.63 
 
 
758 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  47.22 
 
 
971 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  36.04 
 
 
758 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  28.77 
 
 
725 aa  87.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  28.77 
 
 
708 aa  87.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  44 
 
 
434 aa  86.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0515  hypothetical protein  32.56 
 
 
546 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  38.61 
 
 
757 aa  86.7  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  42.2 
 
 
414 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  35.14 
 
 
769 aa  86.3  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  43.52 
 
 
963 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  37.62 
 
 
761 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  44.23 
 
 
386 aa  84  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  39.6 
 
 
758 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  36.63 
 
 
762 aa  83.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  46 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0540  PEP-utilising protein mobile region  41.12 
 
 
558 aa  82.4  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  30.41 
 
 
762 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  40.82 
 
 
809 aa  82  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  33.17 
 
 
791 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0034  phosphoenolpyruvate synthase  40.21 
 
 
806 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  43 
 
 
810 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  36.52 
 
 
760 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  40.78 
 
 
809 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  46.08 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  40.59 
 
 
809 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  46.15 
 
 
821 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  38.61 
 
 
758 aa  80.1  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  40.21 
 
 
808 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  32.67 
 
 
758 aa  80.1  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  39.6 
 
 
754 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  42.42 
 
 
812 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  35.64 
 
 
761 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  39.39 
 
 
803 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  38.14 
 
 
799 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  39.18 
 
 
791 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  37.84 
 
 
760 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>