More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3502 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
347 aa  684    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.09 
 
 
349 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.91 
 
 
365 aa  411  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  57.31 
 
 
354 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.78 
 
 
351 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.87 
 
 
350 aa  322  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.01 
 
 
338 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  44.48 
 
 
349 aa  245  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.64 
 
 
347 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  45.48 
 
 
343 aa  242  7.999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.27 
 
 
349 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.31 
 
 
357 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.48 
 
 
344 aa  225  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.92 
 
 
466 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.92 
 
 
466 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.92 
 
 
466 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 
358 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 
358 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 
358 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.89 
 
 
358 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671749  normal  0.0420203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.64 
 
 
372 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
374 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.15 
 
 
332 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.17 
 
 
330 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
318 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
589 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.76 
 
 
328 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.76 
 
 
328 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.76 
 
 
328 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
320 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  30.59 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
305 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 
340 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
315 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
315 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
317 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
325 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
346 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
341 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.23 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.86 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  25.7 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.93 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  26.53 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  28.4 
 
 
854 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  23.9 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.46 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.46 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
361 aa  67  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 
402 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 
309 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  25.75 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189492  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.199169 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 
324 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  26.37 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
320 aa  63.2  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 
320 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  30.27 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
273 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
315 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2697  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
302 aa  62.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
306 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.82 
 
 
315 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
459 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  25.44 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0581323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>