More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3868 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
358 aa  711    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671749  normal  0.0420203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.82 
 
 
358 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.82 
 
 
358 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.82 
 
 
358 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.88 
 
 
338 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.9 
 
 
349 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.13 
 
 
344 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.38 
 
 
347 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.03 
 
 
466 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.03 
 
 
466 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.03 
 
 
466 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.62 
 
 
357 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.57 
 
 
372 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.53 
 
 
349 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.89 
 
 
347 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40 
 
 
354 aa  215  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  42.15 
 
 
343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  43.23 
 
 
349 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.18 
 
 
350 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.3 
 
 
351 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.42 
 
 
365 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.35 
 
 
374 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
330 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
328 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
331 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
328 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
328 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
340 aa  96.3  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
332 aa  95.9  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.92 
 
 
589 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.69 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  36.22 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.17 
 
 
317 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
680 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  27.01 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
321 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
348 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174057  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
325 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.94 
 
 
349 aa  63.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
321 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.47 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  31.47 
 
 
321 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
677 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.47 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.47 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.47 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.91 
 
 
303 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.18 
 
 
321 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
333 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
321 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.23 
 
 
321 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  29.46 
 
 
340 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 
320 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.18 
 
 
321 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.86 
 
 
329 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
355 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  28.93 
 
 
297 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.46 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0801  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.93 
 
 
849 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
318 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
306 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
330 aa  57  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
305 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.21 
 
 
307 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  25 
 
 
854 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  23.62 
 
 
338 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.39 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  31.21 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0412358  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1836  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311828  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.58 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 
194 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002734  UDP-glucose 4-epimerase  29.51 
 
 
328 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0368  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0497868  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.8 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0127971 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1770  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.759605  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
342 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>