133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8346 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  100 
 
 
357 aa  702    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  83.71 
 
 
362 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.54 
 
 
376 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.03 
 
 
368 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  55.56 
 
 
373 aa  362  8e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.48 
 
 
355 aa  346  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.43 
 
 
388 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27500  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  51.57 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0722  hypothetical protein  37.76 
 
 
366 aa  146  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
589 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
341 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  30.63 
 
 
376 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
366 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
357 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
357 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
357 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
350 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
368 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
317 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
346 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
345 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
305 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
354 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
315 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.71 
 
 
331 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
337 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 
328 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
360 aa  99.8  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
315 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
349 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
402 aa  92.8  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
361 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.86 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  27.18 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  27.16 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
305 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
363 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.6 
 
 
343 aa  63.2  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 
349 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
307 aa  62.8  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.96 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.84 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
312 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.33 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.82 
 
 
351 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
306 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
349 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
372 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.64 
 
 
280 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.83 
 
 
314 aa  52.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
347 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 
347 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.7 
 
 
338 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
349 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
308 aa  50.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.45 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.87 
 
 
317 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.63 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1237  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  23.79 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000110601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.28 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.29 
 
 
508 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.02 
 
 
506 aa  47  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3021  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
349 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  28.65 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 
310 aa  46.6  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
353 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
327 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  27.62 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0225  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein/3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.05 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11546  nucleotide-sugar epimerase epiA  26.99 
 
 
322 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>