92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4356 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 312 aa  606  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  49.23 
 
 		 335 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.92 
 
 		 341 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 		 366 aa  201  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 		 354 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.99 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.85 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 		 359 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 		 402 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.45 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 357 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  29.88 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 357 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 357 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.15 
 
 		 358 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 589 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  28.31 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.66 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.38 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  26.98 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  24.28 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.28 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0465  hypothetical protein  31.86 
 
 		 168 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000872494  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  21.82 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.71 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.33 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.21 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.33 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.33 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.33 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  29.41 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.4 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  27.73 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  27.73 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  30.95 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.86 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.86 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  27.73 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  26.89 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  26.89 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  26.89 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  27.73 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  26.89 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  26.89 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  26.89 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  26.89 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.47 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  28.98 
 
 		 321 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 		 330 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>