215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0415 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  94.4 
 
 
358 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
358 aa  692    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.52 
 
 
341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.85 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.29 
 
 
354 aa  306  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.73 
 
 
366 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.59 
 
 
359 aa  279  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.59 
 
 
368 aa  279  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.2 
 
 
368 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.27 
 
 
346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.31 
 
 
331 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  46.52 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.06 
 
 
357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.06 
 
 
357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.66 
 
 
332 aa  269  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.75 
 
 
357 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.3 
 
 
366 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 
350 aa  252  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
337 aa  252  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.42 
 
 
328 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.96 
 
 
402 aa  236  7e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.36 
 
 
361 aa  212  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  38.51 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 
312 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
589 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
325 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 
314 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
305 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
321 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 
315 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
317 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  29.57 
 
 
357 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.21 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
323 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
318 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 
312 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  35.75 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
368 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  27.08 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.78 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
328 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
331 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.08 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  24.74 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.22 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
351 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4812  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.9 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.31 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  25.79 
 
 
338 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  26.82 
 
 
339 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3346  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.46 
 
 
355 aa  52.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  27.61 
 
 
854 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.78 
 
 
355 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  24.74 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  24.74 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  24.74 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  26.26 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0714  UDP-glucose 4-epimerase  27.92 
 
 
338 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.168591  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  24.74 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  24.74 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  24.74 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  24.74 
 
 
338 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0274  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.41 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.62 
 
 
350 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.93 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
340 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  25.26 
 
 
338 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1511  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.29 
 
 
351 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  25.26 
 
 
338 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  25.26 
 
 
338 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  25.26 
 
 
338 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  25.26 
 
 
338 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
466 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
466 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1601  UDP-glucose 4-epimerase  25.76 
 
 
337 aa  49.3  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383307  normal  0.0692735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6383  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.39 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.953628  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1758  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.93 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.59 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.18 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
466 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1917  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.07 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.20541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>