More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0423 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
305 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98.03 
 
 
315 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  98.03 
 
 
315 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.28 
 
 
317 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.13 
 
 
323 aa  323  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
307 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.88 
 
 
315 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
360 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
359 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 
354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
349 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
346 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.59 
 
 
331 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
368 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
350 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
321 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
345 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.62 
 
 
589 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
325 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
366 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
361 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
368 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
312 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
357 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
357 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  28.89 
 
 
376 aa  109  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.69 
 
 
362 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
347 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
402 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  29.97 
 
 
335 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  28.01 
 
 
357 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 
358 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
358 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
376 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
466 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
466 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
466 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.41 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  27.94 
 
 
373 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
338 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
318 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
332 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.81 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
349 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
312 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
372 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.12 
 
 
336 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.77 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.53 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.95 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  26.78 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.46 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.67 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.12 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002734  UDP-glucose 4-epimerase  25.53 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106036  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  26.13 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
351 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.05 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0307  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.27 
 
 
339 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2883  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.78 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0186538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
328 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.25 
 
 
328 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4468  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.75 
 
 
337 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
346 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.91 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
347 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2182  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.88 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.32 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3239  hopanoid-associated sugar epimerase  28.39 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  26.25 
 
 
854 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.15 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>