More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4448 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
366 aa  725    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.52 
 
 
341 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.92 
 
 
354 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.86 
 
 
346 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.15 
 
 
345 aa  347  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.77 
 
 
359 aa  334  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.24 
 
 
337 aa  328  6e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.14 
 
 
368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50 
 
 
331 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.73 
 
 
358 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.43 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  45.11 
 
 
376 aa  275  7e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.13 
 
 
357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.99 
 
 
357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.99 
 
 
357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.76 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.13 
 
 
366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.05 
 
 
328 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.99 
 
 
350 aa  270  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.51 
 
 
402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  45.74 
 
 
335 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.58 
 
 
332 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 
361 aa  216  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 
312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
349 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
589 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
305 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 
317 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.5 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
315 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
323 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
312 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  30.6 
 
 
357 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
388 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
325 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
307 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  29.15 
 
 
373 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 
328 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.79 
 
 
376 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.54 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
368 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
355 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
332 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
318 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  24.67 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.58 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
331 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.19 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4723  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.91 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.36 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  29.03 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  29.03 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  29.03 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  29.03 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  29.03 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  29.03 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  29.03 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.06 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  30.11 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  30.11 
 
 
338 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  30.11 
 
 
338 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  30.11 
 
 
338 aa  62.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1250  UDP-galactose-4-epimerase  29.03 
 
 
338 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.92 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  30.11 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0722  hypothetical protein  25.93 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2382  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.38 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407349  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.35 
 
 
336 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.79 
 
 
357 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
372 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0595  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27 
 
 
334 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.41 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.63 
 
 
323 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.5 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
305 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4812  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.06 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
317 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2847  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.13 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>