178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2247 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
357 aa  739    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
466 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
366 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
305 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4123  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
358 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160562  normal  0.607841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.62 
 
 
325 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.239778  normal  0.124525 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
316 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.36 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
332 aa  60.1  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
316 aa  59.7  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.76 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
315 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
315 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.4 
 
 
357 aa  56.2  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.18 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.12 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.07 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0531  NAD-dependent epimerase/dehydratase; L-threonine dehydrogenase  26.47 
 
 
321 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  24.48 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.04011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
342 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0689  hypothetical protein  26.47 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0621  hypothetical protein  26.47 
 
 
317 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0658  hypothetical protein  26.47 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.186471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0749  hypothetical protein  26.47 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.293192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
321 aa  53.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0676  hypothetical protein  26.47 
 
 
321 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.61639e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0531  NAD-dependent epimerase; UDP-glucose 4-epimerase  26.47 
 
 
321 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4679  hypothetical protein  25.88 
 
 
321 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.52987e-21 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  23.08 
 
 
330 aa  52.8  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
347 aa  52.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0779  UDP-glucose 4-epimerase  29.71 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  23.55 
 
 
324 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000119526  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0768  UDP-glucose 4-epimerase  29.71 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
315 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0398  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  29.06 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 
321 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  27.22 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  28.16 
 
 
340 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.78 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
372 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1471  hypothetical protein  26.48 
 
 
830 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.24 
 
 
307 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000104829  normal  0.0341268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3986  UDP-galactose 4-epimerase  27.59 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.205233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 
312 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3804  putative UDP-glucose 4-epimerase  28.72 
 
 
303 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0410  UDP-glucose 4-epimerase  27.59 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0889  UDP-glucose 4-epimerase  27.59 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.334492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
317 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.08 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.792015  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.34 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0859  UDP-glucose 4-epimerase  27.59 
 
 
340 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
349 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1988  DNA polymerase 3, epsilon subunit  30.91 
 
 
870 aa  50.4  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
323 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4120  vitamin K epoxide reductase  27.47 
 
 
847 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
349 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
589 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
350 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 
308 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0904  hypothetical protein  27.47 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344615  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
285 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
351 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0745  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.58 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.409564  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  30.73 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  26.63 
 
 
332 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  25.86 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
358 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671749  normal  0.0420203 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0194  UDP-glucose 4-epimerase, putative  25.45 
 
 
318 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
317 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
296 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  23.63 
 
 
328 aa  47  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>