More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0539 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
341 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.52 
 
 
366 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.96 
 
 
337 aa  402  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.62 
 
 
354 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.32 
 
 
345 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.25 
 
 
346 aa  357  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.01 
 
 
359 aa  347  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.41 
 
 
368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.21 
 
 
358 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  51.72 
 
 
331 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  47.96 
 
 
376 aa  310  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 
368 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.52 
 
 
358 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.73 
 
 
357 aa  298  8e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.73 
 
 
357 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.73 
 
 
357 aa  298  9e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.71 
 
 
366 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.96 
 
 
402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.77 
 
 
328 aa  286  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  44.78 
 
 
335 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
350 aa  263  4.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.11 
 
 
332 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.75 
 
 
361 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.92 
 
 
312 aa  205  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 
349 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.18 
 
 
321 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
589 aa  150  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
360 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  32.92 
 
 
357 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
317 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
315 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.06 
 
 
362 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
315 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
323 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
314 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
325 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
388 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.66 
 
 
354 aa  96.3  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
376 aa  95.9  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
355 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  30.06 
 
 
373 aa  92.8  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.58 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 
330 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20130  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.25 
 
 
357 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
466 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
466 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
466 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
332 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  86.3  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
320 aa  86.3  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
349 aa  85.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0820  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17160  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.62 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.764456  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0814  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
365 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00305624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
357 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18870  UDP-galactose 4-epimerase  26.46 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.68 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0926  UDP-galactose-4-epimerase  28.88 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0730766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0840  UDP-galactose-4-epimerase  29.95 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16640  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.54 
 
 
343 aa  60.8  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0903  UDP-galactose-4-epimerase  28.88 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
374 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0871  UDP-galactose-4-epimerase  28.88 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  28.34 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  28.34 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  28.34 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  28.34 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  28.34 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0812  UDP-galactose-4-epimerase  28.88 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  28.34 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  28.34 
 
 
338 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.250439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  24.1 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
309 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0595  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.41 
 
 
334 aa  56.6  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
501 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>