36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0722 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0722  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  734    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27500  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  41.37 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  39.09 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.42 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 		 368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 		 376 aa  146  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.15 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  35.05 
 
 		 373 aa  135  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 		 355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.81 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  23.53 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.4 
 
 		 589 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.02 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 		 345 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.23 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.54 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.98 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.34 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.57 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.29 
 
 		 325 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12084  hypothetical protein  27.98 
 
 		 854 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.620055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3502  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.57 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.46 
 
 		 347 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>