24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27500 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27500  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 355 aa  661    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  43.12 
 
 		 357 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0722  hypothetical protein  44.02 
 
 		 366 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.54 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.89 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.57 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.08 
 
 		 376 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  37.63 
 
 		 373 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.01 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.16 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 		 366 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.47 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.9 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.84 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.32 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.77 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.250439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>