136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5766 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 332 aa  654    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0345  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.65 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.7 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 		 345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.35 
 
 		 354 aa  275  7e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.11 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.65 
 
 		 346 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.924748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.71 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.31 
 
 		 368 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.75546  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.29 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.01 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.95 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0671  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 		 357 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 		 357 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355463  normal  0.130791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0664  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.64 
 
 		 357 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02770  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  44.92 
 
 		 331 aa  242  7.999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10512  UDP-glucose 4-epimerase galE2  39.21 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.39 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.95 
 
 		 337 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.078071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.94 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.23 
 
 		 402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0663  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2723  putative epimerase  37.89 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.4223  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4356  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.45 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.773197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.506058  normal  0.0549316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4146  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0468277  hitchhiker  0.00205504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 		 589 aa  109  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2357  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.23 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141564  hitchhiker  0.00538741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 		 315 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.610304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0012  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000378494  hitchhiker  0.0000148939 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 		 312 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0471  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 388 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.655951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3731  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0997728  normal  0.116407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.760399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.86 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.58 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0477666 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0537  hypothetical protein  30.51 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.571422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8346  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  28.47 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0195709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1961  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2322  hypothetical protein  28.06 
 
 		 318 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1557  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.623146  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3468  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0135706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 372 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0722  hypothetical protein  26.58 
 
 		 366 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.82 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 		 347 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.48 
 
 		 309 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1028  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.03 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  26.06 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 		 310 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 309 aa  49.7  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0899  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.05 
 
 		 355 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4439400000000002e-32 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11480  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.07 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.94 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4886  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352468  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3273  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.95 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.55 
 
 		 406 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4590  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.44 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.44 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1033  putative epimerase  33.67 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  32.99 
 
 		 363 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  32.99 
 
 		 363 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1044  UDP-galactose 4-epimerase  35.25 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21909 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2883  UDP-glucose 4-epimerase  27.27 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0813  UDP-galactose-4-epimerase  27.27 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0786  UDP-galactose-4-epimerase  27.27 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2903  UDP-galactose-4-epimerase  27.27 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0782  UDP-galactose-4-epimerase  27.27 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0680  UDP-galactose-4-epimerase  27.27 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0862  UDP-galactose-4-epimerase  27.27 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0889309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.91 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  32.65 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 		 306 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.96 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28436  predicted protein  33.94 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.981299  normal  0.211421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.9 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>